跟隨白貴沖陣的二百餘人，只逃回了十幾個，但是，他們的犧牲也標誌著明軍的追擊到此為止了。這些復仇之神近乎瘋狂的自殺式襲擊，讓明軍為之喪膽。
李自成等人沒有讓這個機會浪費，雖然已經疲憊不堪，他們卻反而不顧一切地向明軍發起了衝鋒。
跟隨洪承疇渡江的明軍將領中，白廣恩資望最深，所部戰鬥力也最強。然而他卻被這種兇悍至極的方式當陣擊殺，明軍的氣一下子就泄了。面對闖軍的反擊，他們不再硬碰硬地對攻，而是僅做抵抗，甚至還在後退。
洪承疇也沒有辦法。如果是李自成碰上這種情況，多半會帶著自己的衛隊上陣引導進攻，可洪承疇並非能衝鋒陷陣的戰將。他能夠指揮一場戰役，卻不可能引領一次衝鋒。
從嘉陵江邊一直追到這裡，明軍雖然重創反王聯軍，可自身也付出了慘重的代價，前後損折上萬人，尤其是賀人龍部的三千人近乎死絕。此時雖然追上流寇的後隊，卻遭到了不顧一切的頑強抵抗，不能破敵，心中早就沒有多少信心了，白貴的衝鋒也只是壓垮他們的最後一根稻草。
就算是洪承疇，也沒法再催動他們進攻。洪承疇只能繼續派出遊騎，保持對闖軍的追擊襲擾。主力部隊忙著搶救傷員，清點戰損，不再向前追擊了。
這場兩軍總數多達三十餘萬的大型會戰，終於宣告結束。很難說誰勝誰敗，反王聯軍遭到了極慘重的損失，洪承疇、秦良玉兩部官軍陣亡、逃散也近兩萬。
投降官軍的反王一共十人，他們的部下有不少因為不願投降而趁機逃走。再經過裁汰老弱家眷，最終官軍得到了大約三萬人的補充，四川的防務又恢復了起來。
闖軍在達州境內渡過了通川江，這才停下整隊。
跟著李自成留下的兩萬闖軍，減員竟然達半數。爭營只剩下三千多人，党家由於後隊潰散損失慘重，只剩下五千多人了。只有最先過江的混營損失較輕，還有八千餘人。
劉宗敏和田見秀指揮的闖軍前隊，經過了劉文興的叛逃，以及一路上的戰損、逃散，減員也達到了萬人以上。再加上劉體純、楊秉胤、馬朝興三隊人馬的補充，以及收攏了一些其他各營的潰兵，從成都出發時的二十餘萬大軍，已經不足十萬人。
少的那十幾萬人自然不是都死了，有投降官軍的，有逃散了的，但傷亡數量依然十分驚人。幾天之後，嘉陵江下游的回水灣堆滿了泡得發白的屍體，景象可怖之極。從陣亡人數來說，說這是米脂起兵以來最慘重的失敗也不為過。
犧牲並不可怕，關鍵在於犧牲得有沒有意義。而這一次，數以萬計的聯軍士兵的犧牲顯然意義非凡。
暴雨衝垮了多處道路，官軍的給養送不上來，大量的屍體更是一場衛生的災難。淋了雨又缺少保暖設施的官軍成批病倒，四川巡按陳廷謨腹瀉不止，死於軍中，一旬之間，患病士兵竟有上萬。
洪承疇就算有天大的膽子也不敢再作戰了，再這樣下去，要麼被瘟疫消滅全軍，要麼就會爆發兵變，他下令軍隊選擇人口稀少又環境乾燥、有清潔水源的地方分散紮營，躲避瘟疫。雖然洪承疇不懂太多醫學知識，但是單靠經驗總結下達的命令也比較合理，焚燒屍體，隔離病患，遏制了瘟疫大規模蔓延的趨勢。
明軍眼睜睜地看著闖軍從達州東進，攻下了夔州府城。秦翼明部撤回了忠州，防止闖軍向石柱土司報復，湖廣的大門就此打開了。湖廣明軍的主力要麼跟著楊嗣昌去了衡州，要麼跟著方孔炤在湖北東部一帶對抗張獻忠、羅汝才等人，湖北西部只有少量衛戍部隊，防務幾乎是一片空白。
沿江東下的闖軍攻下了歸州，在這裡，他們完成了重新集結。川東、荊襄一代的流民，又有一些歸附闖軍，闖軍迅速重振聲勢。
沒有聯軍了，只有闖軍。該跑的都跑了，現在是農民軍該統一的時候了。
自李自成、劉宗敏、田見秀以下，夔東闖軍主力共有郭汝磐、劉芳亮、袁宗第、李過、黨守素、辛思忠、李友、吳汝義、馬世耀、白鳩鶴、劉汝魁、劉體純、謝君友、馬重僖、高一功十五位老管隊，每一隊的兵力約為五千人。再加上輔助部隊和隨軍家眷，主力闖軍達十萬之眾。
王友進、楊秉胤、馬朝興、劉體統、袁宗道、王可興、郝九松、王汝貴、馬雲翔、李復榮、郝登雲、裘岳等人留守西山各寨，繼續招募流民、屯耕山林，照顧傷兵、家眷，積蓄力量。
「承蒙兄弟們信得過，我李自成便擔當此任了。」李自成站在臨時搭起的高台上，向下一拱手，身旁一面杏黃旗迎風招展，上書四個大字：「奉天倡義」。
「總掌盤」之稱已經不能適應眼下闖軍的狀態了，在宋獻策的建議下，李自成開始使用「奉天倡義大元帥」這一新的稱號。原本宋獻策定的是「奉天倡義文武大元帥」，但郭汝磐表示「那麼囉唆誰記得住」，最後就把「文武」兩個字刪掉了。
老管隊、管隊、小管隊三級模式也已經不能有效地管理如此之多的軍隊。闖軍重新劃分了內部層級，統兵三十人以下的軍官為哨總，百人以下的為部總，三百人以下的為掌旅，千人以下的為都尉。原本的十五個老管隊都改稱果毅將軍，其副手稱威武將軍，劉宗敏、田見秀二人則稱制將軍。
闖軍的內部分工本來就很明確，雖然大家都掛著各種管隊的名頭，但其實早就各有所司，進行這樣的改革並不困難。
「什麼叫奉天倡義？老天爺我們誰也沒見過，過去我覺得，既然皇帝叫天子，那老天爺應該是向著他兒子的。但是仔細想來，這個兒子多半是自封的，就和我們姓李的說自己祖宗是老子差不多，其實我哪認識什麼老子，我老子就是個養馬的。」
「我們挨餓時罵老天爺又聾又瞎，那也是有道理的。古時的聖人說過，『天視自我民視，天聽自我民聽』，可見老天爺的確是耳聾眼花。老天爺看不見，老百姓才看得見，老天爺聽不見，老百姓才聽得見。所以老百姓就是天，天就是老百姓，奉天倡義，就是為了老百姓能活命打仗。」
「我也知道，大家造反的時候沒想當什麼救國救民的大英雄，都是活不下去了，要討條生路。現在暫時活下來了，想的是娶妻生子，傳宗接代，攢點錢弄個窩。這都是應該的，而且我保證，這些都會有。既然帶你們出來造反，就要讓你們將來當兵的有餉拿，回家的有地種。……」
李自成的道理並不全對，他把很多問題都簡單化了，有的是他確實沒理解得那麼深，有的是沒必要對士兵講。
他這場對全軍部總以上軍官的講話主要有三點內容。第一，說明整編後的組織架構；第二，重申紀律；第三，講明下一步闖軍的出路。
出路很簡單，只有四個字：殺朱宰楊。