王瑾在攻下一座城市之後，照例要坐堂審案，尤其是府城這樣的大城市更是如此。有三批人被陸陸續續帶了上來。
第一批照例是城中的劣紳，以及官吏、守備太監等人。吉慶玉呈上的冊子裡已經詳細記載了他們的罪行，總體來說好人不多壞人不少，問問口供，照著判就是。雖然吉慶玉所說不一定是真相，至少比這些人自己說的更接近真相，反正明朝的大老爺也是這樣審案的，王瑾心理負擔也不太大。其中，以守備太監楊澤最為貪婪殘暴，為防止百姓毀屍泄憤，處斬之後直接焚化，深埋於僻靜處。
第二批是牢中的囚犯。農民軍打下城市之後盡釋囚犯是慣例，王瑾比別人謹慎一些，把殺人、強姦、搶劫、縱火這樣的重犯留下重審，其他輕罪的一概放走。
重審倒也不需要包公、宋慈、狄仁傑、福爾摩斯、工藤新一的本領，有幾個被誣陷的，還有那些犯罪但事出有因的，都挺容易審。王瑾處理這種事務已經很有經驗了，這些冤案中，豪勢之家與官員、師爺、胥吏勾結得都十分明目張胆，栽贓手法粗糙至極。怪不得但凡是個既有良心又有膽子的大官，都能平反幾樁冤案。至於那些沒條件勾結官府的小民，絕大多數都缺少知識儲備，所以也搞不成什麼神奇詭異的犯罪手法來。
最後一個犯人居然是鳳陽知府顏容暄，他以為流寇破城肯定會大赦囚徒，於是換上囚服躲進了牢房，想趁亂混出城去。但囚徒中有不少認識他的，他立刻就被揪了出來。吉慶玉的黑名單上也有他一個，判了個斬首示眾。
第三批就難辦了，他們是關押在鳳陽高牆之內的罪宗。
高牆是明朝用來囚禁宗室子弟的監獄，顧名思義，確實有一圈高牆包圍這座監獄，由鳳陽守備太監負責，有二百多名高牆軍看守。很多犯罪宗室及其家屬都被囚禁在這裡，有的關一段時間之後能放出去，有的則是終身囚禁，甚至連子孫後代都囚禁在這裡。直到弘治年間，才允許罪宗子女和鳳陽本地人婚配。此時，高牆內共關押罪宗二百六十五人，連同家屬，總人數在千人以上。
這些罪宗就很難審理了，其中不乏罪大惡極之輩，有的是殺人搶劫，有的是強搶民女，但是，其中也有被冤枉的。宗室也分三六九等，有的宗室像福王、潞王那樣富可敵國，有的宗室連養家都難。這些下層宗室中，有的成了地痞流氓，這也是高牆罪宗的最大來源。但也有安分守己，只想活命的普通人，和其他平民百姓一樣，受到地方官吏、土豪劣紳甚至宗族兄弟陷害，被關押在了這裡。
本地的罪犯很容易審，而罪宗來自全國各地，王瑾就是有天大的本事，也審不明白這二百多件案子。看案卷，每一個都被寫得惡貫滿盈，一提審，每一個都說自己冤深似海。
王瑾索性不審了，所有罪宗全部發往雜役隊挑水砍柴，鍘草餵馬，家眷也不拆散，分入婦女隊、孩兒隊。反正老子是流寇，還怕隊伍里有幾個罪犯嗎？
接下來的問題就是，朱元璋曾經出家的龍興寺，還有鳳陽的明朝皇陵該如何處置？
按照吉慶玉的建議，一定是要燒寺、拆殿、刨墳的。關於鳳陽的龍脈，早就有各種各樣的傳說，吉慶玉也都整理出來了，還有本地道士獻壓勝之法。
自然，王瑾一個都沒採納。
「昔日朱元璋入南京時，揭榜禁剽掠，有卒違令，斬以徇。降兵疑懼不自保，元璋解甲酣寢達旦，眾心始安。居民各安堵如故，賢士禮用之，舊政不便者除之，毋使吏貪暴殃民。以康茂才為營田使，勸農桑，發粟振貧民。由是得軍心、紳心、民心，雖仍有缺憾，亦足為其時群雄之冠，故可得天下，與鬼神龍脈這等虛無縹緲之說何干。」
「陵中所葬，乃是朱元璋的父母兄嫂，皆與我等一般，是亂世中之苦命人，生前不得享絲毫福澤，死於饑寒病痛，更無半分傷害於人。縱然後世子孫不肖，我等又何必與冢中枯骨為難？」
「當年朱元璋亦一窮漢，於皇覺寺，即今日之龍興寺中出家，不過想苟全性命於亂世。怎奈元兵殺良冒功，逼其不得不反，這才有了明朝的太祖皇帝。可是朱家人做了皇帝之後，又來欺壓我等窮漢，大明朝的官兵又來殺良冒功。」
「我非但不會燒寺毀陵，反倒要在皇陵享殿祭朱元璋，凡是反抗暴政，於百姓有益之人，都是我們的先輩。」
王瑾在皇陵中布設了祭壇，告祭朱元璋，但是這個祭典對於大明朝來說相當尷尬。
王瑾祭奠的不僅僅是朱元璋而已。排在第一位的是韓山童，其次是劉福通，然後是大宋皇帝韓林兒、天完皇帝徐壽輝、大夏皇帝明玉珍，此外還有彭瑩玉、周子旺、芝麻李、布王三、孟海馬、郭子興、毛貴、關先生、破頭潘等元末義軍領袖，接下來才是朱元璋和明朝諸開國功臣。就連被朱元璋清算的藍玉、李善長等人，也都在祭祀之列。
列入祭祀行列，並不代表王瑾完全認可此人的作為，在不少人的祭文之中也多有批評之辭，但是對於這些人反抗元朝暴政，匡天下重歸太平的貢獻，還是要感謝的。
「昔者齊宣王問孟子：『湯放桀，武王伐紂，有諸？』孟子對曰：『於傳有之。』宣王曰：『臣弒其君，可乎？』孟子曰：『賊仁者謂之賊，賊義者謂之殘，殘賊之人謂之一夫。聞誅一夫紂矣，未聞弒君也。』……」
「《尚書》曰：『天視自我民視，天聽自我民聽。』……」
「桀紂之失天下也，失其民也；失其民者，失其心也。……」
「凶年飢歲，百姓老弱轉乎溝壑，壯者散而之四方者，幾百萬矣；而藩王、勛貴、閹豎、官紳之倉廩實，是上慢而殘下也。……」
「《湯誓》有云：『時日曷喪，予及汝偕亡。』……」
「仰不足以事父母，俯不足以畜妻子；樂歲終身苦，凶年不免於死亡。……」
「庖有肥肉，廄有肥馬，民有飢色，野有餓莩，此率獸而食人也。」
「有布縷之徵，粟米之徵，力役之徵。君子用其一，緩其二。用其二而民有殍，用其三而父子離。……」
「惟仁者宜在高位，不仁而在高位，是播其惡於眾也。……」
「夫人必自侮，然後人侮之；家必自毀，而後人毀之；國必自伐，而後人伐之。……」
王瑾對儒家典籍所知很少，用的都是很基礎的內容。他用這些來論證朱元璋參加紅巾軍，反抗元朝暴政是正義的，同時也論證現在他們反抗明朝暴政是正義的。但尷尬的是，王瑾讓趙束鄉操刀所作的這篇祭文中引用的儒經，正是朱元璋做了皇帝之後下令禁絕的那部分。
句句都是孔孟，句句都是造反。
祭文是一個投降的宗室宣讀的，王瑾則在一旁用白話文翻譯給闖軍諸將。謝君友說：「我還道文廟裡的供奉老夫子都是道學先生，現下看來是錯怪他們的，怪不得他們是聖人，說的話果然大有道理。」王瑾說：「那是自然，因為聖人已經死了，所以他們說的話永遠有道理。我們來替聖人說話，便有造反的道理，做官的來替聖人說話，便有不讓造反的道理。」
看著焚化牌位和祭文的烈火，王瑾心裡想到的是那段雖然出自小說，卻很適合元末群雄與現在的闖軍的話。
「焚我殘軀，熊熊聖火；生亦何歡，死亦何苦；為善除惡，唯光明故；喜樂悲愁，皆歸塵土；萬事為民，不圖私我；憐我世人，憂患實多；憐我世人，憂患實多。」
無論紅巾軍還是闖軍，都沒有幾個人能真的不圖私我。但只要能為國為民去犧牲，又何必管他們為什麼。
文章已經作完，接下來的工作就得靠刀槍來完成了。王瑾不由得哼起了熟悉的旋律：「僅憑筆尖弱小怎能保全，拼著血汗大同實現何難……」