穿越者是對所有從現實世界穿越到遊戲王世界的決鬥者的統一稱呼。 穿越者的決鬥以勝利為目的。使用現實中的主流卡組，能夠駕馭決鬥怪獸的精靈力量。穿越者穿越到這個世界時，會隨機接受所使用的卡組主題世界的考驗或者認可，通過之後方可使用該系列卡組（並且受羈絆影響，大概率提升抽到關鍵卡的機率）。 處於某種原因，穿越者集合起來，組成了名為「普羅米修斯」的，以創造屬於他們理想世界為目的而使用各種手段的組織。 身為穿越者一員的東方游暮，醒來之後，便來到了5DS這個世界。 背後靈弗勒德莉絲，給自己發布任務的來歷...