穿越至神奇寶貝世界的現代三好青年輝夜，手握逆天級別的神秘抽籤系統。紅豆杉視他如親弟弟，大木博士則成為他的授業恩師，而芽衣與透子，則是他一同成長的夥伴。 前所未見的龍系伊布進化形態，你見識過嗎？ 持久激活X模式的噴火龍，你是否曾親眼目睹？ 能夠駕馭仙人模式進而實現mega進化的妙蛙花，你可曾聽聞？ 擁有如同內瑟斯般強大力量的路卡利歐，你可曾見證其風采？ 輝夜憑藉這神秘的抽籤系統，在神奇寶貝世界中嶄露頭角，成為最強的訓練家，挽救了這個世界，然而當他驀然回首時，才意識到自己的系統似乎也給其他人...