雖然如此，闖軍也並沒有真的強攻。到了半夜，曹變蛟和孫守法悄悄溜了。經過了兩天的連續作戰，闖軍雖然氣勢正盛，但體力實已到了極限，追著官軍一陣放銃放箭，趕走了他們便算。
從襄樂鎮之戰至今，闖營陣亡約兩千人，亂營陣亡、逃散三四千人，亂營收得官軍降兵一千三百餘人。曹文詔部全軍七千五百餘人，曹變蛟和孫守法最後只收攏到一千六百餘人。
儘管付出了慘重的代價，但這一戰終究是聯軍勝利了。孫守法逃得匆忙，將所有輜重一概拋棄，令聯軍得到了很大的補充。反正已經敗得這麼慘了，曹變蛟和孫守法索性破罐子破摔，一路跑回了三原縣，北到慶陽，南到鳳翔，西到平涼，東到三原，再無官軍主力。聯軍先破真寧，再破三水，一路殺官戮紳，搶奪糧秣，緊接著向東南進軍。闖營攻下耀州，亂營攻下淳化，分別威脅三原縣和涇陽縣。
洪承疇緊急返回三原，會合曹變蛟和孫守法部署防務，緊急收縮兵力，將趙光遠、左光先、賀人龍、尤翟文、張全昌等部都調到西安來支援。尤翟文是尤世威、尤世祿兄弟的堂弟，現任延綏鎮靖邊營參將，張全昌則是寧夏靈州所的參將。好在闖亂聯軍經歷了之前的惡戰，部隊需要時間恢復，短時間內還無力發動攻擊。
曹文詔的死令戰局發生了極大的改變。首先，洪承疇的兵力是克丁克卯的，一下子少了五六千人，剩下的那些殘兵把輜重、火器、盔甲都丟沒了，想再恢復戰鬥力也要很長時間。這七八千人的兵力缺口需要洪承疇從陝西各地抽調兵馬來補充，可就算抽調來，又有多少能達到曹文詔和他麾下老兵們的水平？所以也就需要更多的人，花更多的錢。重新抽調部隊，要補齊之前拖欠他們的軍餉，要很大一筆開拔費，要重新給他們準備甲仗軍械，一路上要供給他們食宿，所有這些開銷，都令洪承疇本就不寬裕的經費狀況雪上加霜。
其次，曹文詔威名素著，擊滅的大小反王不計其數，現在曹鎮遭到如此慘敗，曹文詔授首，關中各地官紳為之氣奪。洪承疇的堅壁清野之策之所以能執行，就是因為有曹文詔這樣的主力部隊能及時支援各地的州縣塢堡。可是現在洪承疇採取守勢，各地官紳得不到支援，又因曹文詔之死深深地感到恐懼，面對流寇時，死拼硬打的念頭便大大降低，往往更傾向於選擇採用花錢買平安的方式，送出一批錢糧物資勸流寇離開，這使得洪承疇的堅壁清野政策根本收不到預期的效果。
最後，就是闖軍的實力和士氣都有了巨大提升。曹文詔既破，也就沒有哪支官軍是闖軍不能打的了。繳獲的曹鎮裝備補齊了闖軍的缺口，新兵也得到了鍛鍊。
不過，殲滅曹鎮只能治標，讓雙方巨大的實力對比稍微改變一點而已。明朝對於闖軍來說，依舊是個恐怖的龐然大物。失去曹文詔固然是個慘重的損失，但這樣的局面還不至於讓洪承疇應對不了。三原縣的臨時總督衙門中，大小官將幕僚進進出出，新的計劃正在迅速醞釀。
花開兩朵，各表一枝，再說井岡山這邊。
這些天，孫可望覺得前所未有地累，王瑾竟然在井岡山的局面剛剛穩定下來之後就帶著少數衛兵離開了，現在所有的內政工作都是他在負責。別人也還罷了，黃色俊、劉文炳、劉弘才這三個叔父都受他節制，實在是讓他彆扭至極。
好在孫可望只管政務，並不管軍務，軍事方面的工作都是黃色俊和二劉處理，凡事與劉文煌協商。
真正要命的是，王瑾並沒有布置具體的建設方案，只指出了一個大概的思路，具體的問題都得孫可望自己摸索。
這其實沒什麼奇怪的，王瑾要是知道該怎麼幹，還能扔給你嗎？
按照王瑾指點的大略以及與劉文煌等人的商議，孫可望的工作思路大體上是這樣的。
第一，田兵組織。
王瑾一貫堅持，本時代的才是最好的，所以他搞的不是農會，而是田兵，也就是照抄十年後閩贛邊區農民的智慧。
但區別在於，田兵是農民們自發組織的，闖營需要的卻是一個自上而下建立的組織。如果換成別的反王，這事就不要想了，但王瑾這四年也沒白忙活，給闖營攢下了一些家底。
目前井岡山地區的闖營兄弟中，能夠下到基層充當幹部的大約有一百人。王瑾的標準定得相當低，包括認識一千個左右的漢字，能進行一百以內的加減乘除計算，了解時間、重量、長度的計量單位，對幾何圖形有初步認識。能夠辨認方向，掌握自然、社會基本常識。
這也就是小學二年級的水平，但是以闖營這樣的條件，花四年時間竟然能教出這麼多小學二年級水平的徒弟，甚至有孫可望、李定國、劉文秀他們這樣極個別初中生水平的學生，已經是個了不起的奇蹟了。這還是因為孫可望生父和李定國的上一個養父都是小商人，劉文秀的生父是個窮秀才，他們本來就識字，省了王瑾大量的時間。王瑾覺得可以充任幹部的這一百來人里，也有相當一部分人曾經是商人、店伙、胥吏或未能進學的讀書人，不全是王瑾教出來的。畢竟闖營兄弟們的主業還是打仗，腦力勞動也得消耗熱量，一天兩頓粥，訓練之後再讀書算數，也得頭暈眼花。
整個闖營控制區的人口有一萬多人，青壯年男性有四千多。王瑾便以一個丁壯及其家眷作為一戶，十戶為一什，十什為一佰。什長都由百姓自行推選，佰長一正一副，正佰長是闖營兄弟，副佰長是劉文煌的部下。因為語言不通，闖營兄弟與本地人交流很可能，這個暫時沒辦法解決，只能安排正副佰長同吃同住，讓佰長儘快學習方言。
十佰為一仟，闖營轄區共分為四個仟，分別由張金榜、霍四、苗惠民、孫大成四人擔任仟長。這四個人原本都是闖軍的小管隊，是老弟兄中水平比較高的。
因為有劉文煌這個本地的山大王帶路，闖營中識字的人也夠多，四千多丁的人口統計還是比較好做的。由劉文煌出面解釋闖營不抽丁服役，不收丁銀，靠著他的威望做外掛，整個過程也沒發生什麼衝突。
田兵組織基本上取代了原來的衙門的職能，設有吏戶禮兵刑工六科。劉弘才掌吏科，吉慶玉掌戶科，趙束鄉掌禮科，劉文炳掌兵科，魏嘉隆掌刑科，張敖掌工科。魏張二人原本都是督戰隊的成員，在王瑾部下很久了。
原本由衙門負責的一切事務，都由田兵組織代管。這樣的辦法全面推廣自然不現實，但是在這樣小的區域內，闖軍有上千戰兵，要全面統治這塊只有四千丁壯的地區還是能做到的。