太平軍主力第一鎮在鎮將葛義指揮下，從三個方向往吉安城下集結。與此同時，第十五鎮、新一鎮也開始向吉安其餘三個城門發起進攻。本來，按戰前部署第十五鎮和新一鎮只是助攻，以牽制吉安守軍，主攻方向仍為南門，由第一鎮負責。但戰鬥打響後，新一鎮的鎮將王輔臣卻派人飛馬向周士相請命，請求將助攻改主攻。周士相欣然同意，命董常清修改軍令，各部皆為主攻，先下吉安者為首功。此令一下，再加上軍帥府剛剛頒授軍功授爵制，諸鎮將領無不想獲首功積功授爵，故而人人奮勇，戰意高漲。
四門同攻，清軍立時感受壓力。周士相命炮兵將能夠快速移動的虎蹲炮和各式輕型銅炮都向前推進，以猛烈的炮火壓制吉安清軍。清軍也是孤注一擲，劉光弼、楊文遠等人命將能用於守城的器械都給搬上城頭來，「萬人敵」、猛火瓶、石灰、擂木、石塊堆滿城頭，架起的大鍋用熱油熬著糞汁一起燒得滾濺，只待太平軍上來就倒下城去，燙他們個死去活來。
第一鎮向城牆抵近，降軍們收到了撤退的命令，頓時如蒙大赦，卻知道不能從正面去衝擊太平軍的陣列，一個個十分小心的從兩側繞過。
清軍的火炮基本啞了聲，現下轟鳴的都是太平軍的火炮。望著城下的紅色海洋正一點一點的向城牆接近，清軍上下都是緊張萬分。
總兵楊文遠右手緊緊的握著佩刀，大氣也不敢喘一聲，直直盯著壓迫上來的太平軍，對身後大鍋熬煮金汁發出的惡臭味恍若未聞。四周清兵同樣也是如此，人人直直盯著太平軍，面色卻是蒼白無血。一些弓箭手的手因為緊繃弓弦，都被勒出了深印。青壯們也是面無人色，人人膽戰，但卻咬牙堅守崗位。有人更是幻想長毛賊爬城時，能僥倖殺上一人，好去提督大人的銀箱中抓銀子。
讓清軍意外的是，進攻南門的太平軍抵近之後，卻是沒有如那些降軍般潮水湧上攀城，而是在鼓聲和嗩吶聲的指引下在城下列成一個個方陣。
清軍不明白太平軍這是何打法，一個個眼神滿是困惑，不過很快他們就弄清楚了太平軍是要幹什麼。
「預備，放！」
隨著軍官的命令，第一鎮的3000多銃兵將銃口對準了城上打響了手中的火銃。一排接一排的士兵輪流發射，鉛子鋪天蓋地，整個城牆的上空到處都是鉛彈呼嘯飛過的聲音，城牆亦被打得「砰砰」直響。城上的清軍初始不防，被密集的銃子掃倒一片，爾後驚覺過來，城上再也不見一人，均是趴伏在下以避銃子。
清軍無不憋屈，太平軍不攻城，只在那用密集的火銃壓制城頭，讓他們頭也不敢抬一下，何談殺傷敵人。
吉安總兵楊文遠從未經歷這種打法，一時慌了手腳，待反應過來想探頭察看太平軍動作時，一顆銃子正中他頂上紅櫻，震得他頭盔一顫，嚇得一下又縮了回去。
第一鎮裝備最新配發燧發槍的300士兵都是軍中用銃老手，相對於準頭不是很好，射速也較慢的火繩槍，這些靠火石擊發的燧發槍使用起來不僅順手，而且威力奇大，唯一遺憾是藥子裝填尚未得到改進，但總體比之先前使用的火繩槍卻是要強大許多。
300燧發槍瞄準城頭一片區域，以百人為一隊，不間斷的射擊。如此密集的火力，雖然城上清軍有著城牆的掩護，但也死傷了不少的人，甚至於有一種被壓得抬不起頭來的感覺。那種感覺又如在水中不得呼吸一般，壓抑得人心直跳，壓抑得人直想發狂。
「轟」的一聲，一顆實心大鐵彈不偏不倚的正中城樓上的劉光弼將旗，旗杆「吱呀」一聲倒了下來，嚇得劉光弼趕緊命親兵去將將旗重新升起來，要不然對於守軍士氣可是極其沉重的打擊。
劉光弼打後金天聰年間就隨八旗征戰，從未見識過用火器如此厲害的明軍，一直以來也都是他領兵壓著明軍打，這回卻是被明軍壓著他們打，心中滋味很是不好受。同時也是暗自佩服，那賊秀才果然是名不虛傳，難怪平南王尚可喜、靖南王耿繼茂，簡親王濟度，靖南將軍羅托、廣西提督線國安他們打他不過，就是那胡文升死的也不冤。如此戰力，如此戰術，天下強兵誰能出其左右？
佩服同時，卻是更加憎惡，自崇禎年間流民造反以來，這天下足足亂了三十年，如今好不容易偽明朱由榔棄國，雲貴平定，大清即將一統天下，正是百姓休養生機恢復之時，這賊秀才卻平空殺出，使得形勢大變，戰亂又要持續下去，卻不知又要枉死多少人。
劉光弼咬牙切齒，恨不得將賊秀才生吞活剝，但此刻的他，卻是困在城樓之中動彈不得。
南門清軍被壓在城頭不得動彈之時，其餘三門太平軍攻勢越演越烈，清軍傷亡慘重，各門守將不斷派人來求提督大人派發援軍，劉光弼又哪來援軍可發。隨著時間流逝，太平軍的炮手也是打得熟絡，炮子打得越發精準，城上清兵就是躲在城垛後也往往叫炮子砸中。有士兵為了躲避炮子砸落的石塊而躍出，結果頭剛冒出，就被城下的銃子打得血如涌注。
傷亡之大，已是劉光弼和楊文遠等人難以接受了，那些青壯死的再多，他們也毫不在乎，因為這些都是可以隨時補充的。只要吉安城中還有人，就不怕征不來人。可那些經年老兵的損失，卻是無法得到補充，尤其是督標親兵，這些可都是他們的生存本錢，打沒了就打沒了。
劉光弼的心抽搐得厲害，一開始，他是期望使用青壯來消耗太平軍的火器，損耗他們的兵力，再以嫡系督標兵重創他們，可是太平軍這種只靠強大火器壓制城上，卻不攻城的戰鬥方法讓他有力使不出。
炮聲、銃聲不停的響著，好像永遠都不會停歇，天知道長毛賊是從哪弄來這麼多火銃和藥子的。
劉光弼有一種抓狂的感覺，就像是要折磨人一樣，偏偏不肯一次折磨完，就這麼一刀一刀的刮下去，直颳得他遍體磷傷，直颳得他血流如柱，直颳得他肉去骨現，直颳得他一命嗚呼。
城上有青壯受不了這種挨打的壓抑，開始在城上逃散。清軍立即進行鎮壓，楊文遠的親兵手起刀落，就是幾十個人頭落地，那些青壯一陣驚慌，不敢再往城下逃，硬著頭皮貼著城牆蹲在那。
太平軍的炮子和銃子打得再凶，只要他們不攻城，這城便丟不了。任憑太平軍打了一會，清軍有明白人暗自鬆口氣，覺得太平軍十分愚蠢，倘此時攀附攻城，城上守軍哪有餘力反擊。這幫蠢材不趁此奪城，只在那胡亂放銃，又有多少藥子可用。等到藥子打完，你還不是得攀附奪城，那時守軍也是回過神來，十八般器械用上，你又有多少人命可填。
抱這想法的清軍將領不在少數，劉光弼也是如此想，然而他們卻不知，城下太平軍中有一隊臂帶紅袖的士兵已經抱著一個個正方形狀，用絲綢包裹的物件鑽進了城門洞子。
周士相拿著千里鏡注視著南門，等著那聲巨響。很快，一聲巨響傳來，只見城門洞子黑煙一片，沉重的城門被炸飛，城門後堆積的石塊如天女散花般向城頭、向城下砸去。
「城門破了！」
清軍大驚，城下侯命的青壯嚇壞了，劉光弼一個激靈，顧不得頭頂上方飛舞的炮子和銃子，趴牆往城下一瞧，頓時吸了口冷氣，視線中，無數紅衣太平軍已經湧進了城門。
南門一破，清軍頓時大亂，劉光弼和楊文遠等人慌忙領軍欲將攻入城中的太平軍趕出去。城下數千青壯被清軍催逼著去填城門，可根本擋不住衝進來的太平軍。一些青壯急於逃命，這節骨眼直接拿起武器同彈壓他們的清軍廝殺起來。
這種情況發生，劉光弼知道壞了，他不可能再控制城中情形了，()趁著太平軍還沒有完全攻陷南城，領著親兵便往北門跑去，想從那裡趁亂衝出逃到吉水去。可人還未趕到北門，北城那迎面就退過來一幫子敗兵，不用問，北門也是失守了。
劉光弼只覺天旋地轉，慌忙間根本無處可去，只如喪家犬般領著殘存親兵在城中東撞西奔，最後被太平軍圍於一處民宅之中放火活活燒死。
總兵楊文遠在城破之後領兵奮勇頑抗，後與知府陸國孝等人退入府衙。楊文遠自知絕無活理，故而很是瘋狂，死戰不退，最後力竭被太平軍活捉，綁在府衙前當街砍頭。知府陸國孝、同知塗文均、知縣劉同纓等一干吉安大小官連同家眷均被太平軍處決。入城太平軍挨街沿巷，挨家入戶搜查清兵和青壯，凡兵者一經發現立即格殺，青壯者則拉往城外，計捕殺清兵4000餘人，捉青壯兩萬餘。當夜，太平軍將青壯分成數營，以三人抽一丁者處斬，計殺青壯六千餘。次日，周士相下令將城中士紳大戶及其家人盡數押往城外，連同老弱共計1560餘人全部驅於河中溺死。
城中搜捕直持續了三日方止，計殺紳民清兵近兩萬人。