（3）
保留未在戰鬥中損毀的人工靈魂容器和蓄積型能量發生裝置。
優化過去的武器可變系統、懸浮系統、二段跳系統、緊急加速系統。
採用寄葉部隊的技術構造身軀，但在皮膚之下增加一層高抗力裝甲。
增加EMP防禦系統，增加攻擊招數類型。
在原本的臉型的基礎上，往帥氣的方向補完仿人類身姿。
——當其他產業都在按部就班推進之時，萊爾藉助寄葉部隊的設備和雙胞胎姐妹的精密操作機能，優先將Zero和X的新軀體製造出來。
「現在只剩下最後的問題，他們還是一千年前的Zero和X嗎？」萊爾站在仍在沉睡的『赤色破壞神』和『傳說中的英雄』面前，久久沒能按下啟動按鈕。
狄波洛奇怪道：「主人，您不是說他們的容器沒有受損嗎？」
這不是運氣好，而是當初爆發戰鬥時雙方都刻意沒往頭部攻擊，大概還是抱有『待事情結束後將對方的身體修好』的想法。
萊爾在實驗室里左右踱步，將心中的煩惱說出來：「先假設我當初說的靈魂學說成立，人類的靈魂寄宿於大腦上，人造人的靈魂寄宿於我發明的容器上，而非四肢軀幹上……要說證據的話，千年前就有富豪為了續命，將自己的腦袋割下來接到受疫病影響較輕的市民的身體上，而組合出來的人類百分之一百是那名富豪。」
附帶一提，科學家們曾考慮過無限量地克隆萊爾，將人類的腦袋移植到萊爾的克隆體身體上，但因克隆體被確認沒有免疫超級疫病的能力不得不宣布方案破產。
「人類十分脆弱，稍微出點問題腦袋的機能就會失效，從而導致死亡。人造人的身體很堅實，但失去了動力源也會導致容器停止運作。」萊爾設計的人工靈魂的容器，不管再怎麼黑技術，也只是建立在物質基礎上的一套東西，「那麼問題來了——到底怎麼樣才算死亡？」
「……死亡。」波波洛嘗試跟上萊爾的思路。
「按照目前的觀點，Zero和X於一千年前便已經陣亡了，但他們的狀況實際上跟我很相像，被人塞在冰箱裡的我的大腦同樣運作不能。」萊爾停下腳步，聳聳肩，「但多虧了你們，我現在又活過來了，而且通過我那無法用科學解釋的天賦，我可以確定自己就是千年前的通緝犯……那他們呢？」
雙胞胎點點頭，靈魂學說什麼的她們不懂，但萊爾至今展現出來的科研能力和博學程度，已經讓全體人造人確信【萊爾就是造物主】一事。
萊爾伸出兩根手指，繼續道：「如果等會兒確認Zero和X也沒死，就意味著兩件事。其一，容器不損壞你們就永遠不會死，趕快將之前被判定為『陣亡』的人造人的屍骸挖出來重新啟動；其二，本大爺不小心釀成了無數的悲劇，本應投胎轉世的亡魂因為我的設計缺陷被困在容器里。」
狄波洛和波波洛對視一眼，不知道該說些什麼。
釜底抽薪的解決辦法是『靈魂學說是封建迷信』，應該尋找另一種可以解釋『極其複雜的結構下誕生意識』這個現象的理論。但在她們腦洞大開想出一套猜測前，這只是為否定為否定。
「唉，無形之物的探索，比整個銀河系所有星球加起來都要困難啊……」萊爾長嘆一聲，他本來就沒想過從別人口中得到任何有參考價值的意見，當即走到儀器面前，摁下啟動按鈕。
（Warning！Warning！）警報燈閃了兩下。
源自寄葉部隊的激活裝置滑蓋打開，氣缸將紅色著裝的Zero和藍色著裝的X推送出來。
能量發生裝置啟動，能源時隔千年流經人工靈魂容器。
同一時間，兩人張開眼睛。
「……父親大人？！」
「是狄波洛和波波洛解救您了嗎……？」
赤色破壞神和傳說中的英雄恢復意識，第一句話就說明了最重要的問題。
「別的問題先擱在一邊。」萊爾沒有顯得多激動，站在他的視角，在地鐵通道內與Zero和X分別不是太遙遠以前的事情，「Zero、X，告訴我你們是為了什麼而戰鬥，我明明按照『自古紅藍出CP』的原則給你們配色，你們給我來一手同歸於盡？」
「正如父親大人所說，今後是人造人的時代，為了全體人造人的未來，我不能再讓那些苟延殘喘的人類限制人造人的未來！」
「即便要解放人造人，也不該扼殺成千上萬的生命，裡面很多都是一群安分守己的平民而已，以血腥殺戮創造自由絕對是錯誤的！」
這就是他們一方被稱為『赤色破壞神』、一方被稱為『傳說中的英雄』的原因。
即便已經同歸於盡過一次，他們仍舊堅信各自所走的道路是正確的。
「……因理念不同而戰鬥，那還說得過去。」萊爾擔心的是他們為『誰更強』這種無聊問題而戰鬥，聞言皺起的眉頭舒緩下去，「狄波洛，告訴他們這一千年來發生了些什麼，儘可能詳細點。」
「是，主人。」狄波洛走上前。
「什麼？！」
「一千年？！」
（4）
被A2重創的亞當，被2B重創的夏娃，總算是恢復了過來。
在此期間，他們也通過不可思議的學習能力極速成長。亞當成為一個文質彬彬的美男子，酷愛舊時代人類的文學作品，對人類有近乎狂熱的探究欲望；夏娃頭腦不怎麼樣，對人類的興趣也不大，是個重度兄控。
當然，精神上的成長帶動著戰鬥力的提升，他們再也不是剛出生時連如何反擊都不會的菜雞。
「怎麼回事……沙漠消失了？」傷愈後正想去捉捕最後的人類的兩兄弟，剛走出山洞，卻發現原本熟悉的沙漠變成更厚實的岩漠。
「夏娃，往南方走走。」亞當眉毛一挑，以瞬移能力趕路。
嗯，他們的『走走』是這個意思。
往南走一段路，岩漠變成泥漠；再往南，泥漠變成貧瘠的泥土，但已經有些綠色的植株；繼續往南，泥土變得肥沃濕潤，綠油油一片，有一隊機械生命體在平整地面。
兩兄弟不用多說，直接瞬移到機械生命體旁邊，接上網絡獲取情報。
「伊甸園發生器？真不錯啊，還有這種東西。」夏娃對環境的需求很小，無論是在沙漠和在平原都能生活，但他似乎也有『美麗』的觀念。
至於亞當，俊美的臉龐卻呈現變態的笑容：「是最後的人類的傑作……不愧為既擅長創造也擅長毀滅的無比矛盾的種族！我的探求心越來越高漲了~！」