主持人：『連續舉辦了一個星期的漩渦列島大賽，今天終於迎來了尾聲。接下來，我們有請麻亞神官，將優勝的獎品——神秘的水滴。
頒發給在經歷了激烈戰鬥之後，贏得本場大會優勝的冠軍，小霞小姐。』
神官麻亞：「恭喜你了。」
小霞雙手接過了遞來的神秘水滴，激動地說道：「謝謝。」
主持人：『讓我們一起來恭賀，新的大海勇者誕生啦！』
「啪啪～」
「哇哇～」
觀眾席上，鼓掌聲與歡呼聲不絕於耳。
在小霞得到了神秘水滴後，大木鶴等人又朝著漩渦列島的島嶼之間開始了旅行。
與此同時，在銀岩島附近小島沖島的海域內。
這裡的海底下，有一座隱藏在海底的基地。
「南波博士！」
「哦！是哲也呀！這次蘭斯將軍能派你這樣的強者來相助，我們捕捉神秘神奇寶貝X的計劃，那就更加萬無一失了啊！」一個是地中海，卻留著櫻花色頭髮大中年男人，對眼前的青年誇獎道。
「博士，您過獎了。」
「呵呵！哲也你太謙虛了。對了哲也，你要不要試試我的南波南波五號。這可是我潛心研究的好東西啊！」
對於研究員來說，自己研究的東西能得到別人的認可，那就是最值得驕傲的事情。
眼下的南波博士，就是想給山上哲也推銷一下自己的發明。
「南波南波五號？」
這個名字取得，南波博士未免也太自戀了吧！山上哲也心中吐槽著，但面上卻是充滿了疑惑道：「博士，那是？」
「就是這個啦！我跟你說啊！這可是我.....」
就當南波博士，向山上哲也推銷自己的研究成果時。
在離海底基地不遠處，名為沖島的偏僻島嶼附近。此時正有一個小男孩，帶著三隻神奇寶貝在海中玩耍。
...
而另一邊，此時的大木鶴四人也追尋著神秘神奇寶貝的傳說來到了沖島。
在這裡，四人遇到了闊別已久的阿弘。
聚在一起的五人，經過了一番探討後，猜測越稀有的神奇寶貝，肯定是越喜歡待在人跡罕至的地方避免外人打擾的。
所以，沖島附近的一座無人小島，就是一行五人的首要目標。
而了解原劇的大木鶴知道，這次自己等人會在這裡，碰到洛奇亞寶寶和它的麻麻。
「咘嗚嗚哦～」（那就是父親認定的人嗎？）一道黑色的稚嫩身影，用它血紅的雙眼眺望遠方。
「嗯！」
隨著一行人划船來到了無名小島時，大木鶴突然感覺到心中有個聲音響起。
「'阿鶴，你怎麼啦？」
「不，我沒事。」
嘴上這麼說的，但大木鶴感覺內心中有個聲音在呼喚自己。
...
「額！有人來了。小銀、小黑，你們先躲進水裡。暫時不要出來，也不要發出聲音。」
「撲通！」
看到大木鶴一行人登島，正在戲水的小男孩立即提醒身邊的兩隻特殊神奇寶貝。
「嗯！小黑，你怎麼不潛入海底啊！」
「咘嗚嗚哦～」（我等待的人要來了，怎麼可能離開呢！）
「不行啦小黑，你快點潛入海中啦！被人發現可就遭了啦！」
「咘嗚嗚哦～」（不需要你來提醒。）
就在小男孩苦勸小黑時，找尋神秘神奇寶貝的大木鶴等人，已經來到了附近。
「那是？洛奇亞！還是黑色的。」
此時大木鶴有些懷疑，是不是時間過得太久自己記錯了。
這裡應該是一隻正常體色的洛奇亞，怎麼現在變成了閃光變異的呢？
「洛奇亞！就是那個嗎？可是，這個顏色好像有點不對吧！」
正當一行人圍攏過來時，海中的小男孩內心立即緊張了起來。
「你們想要幹什麼，電燈怪。」
「啦哈哈哈～」（不許你們靠近！）隨著小男孩大指令下達，一旁的電燈怪頭上的雷電凝聚，一副蓄勢待發大模樣。
「喂！小弟弟，你是守不住它的。所以，還是換更有實力的人來吧！」
看到了異色洛奇亞的第一眼，就激發了大木鶴心中對力量的渴望。
普通的閃光精靈，就已經是很稀有了，更不要說是閃光的神獸了。
而且，還是站在神獸第一梯隊的洛奇亞了。
這樣的力量，換誰心中不會迷糊呢？
此時的大木鶴，慢慢地靠近著閃光洛奇亞，手上也已經握著一顆精靈球了。
「你想要幹什麼？你不要過來啊！電燈怪！」小男孩再傻，也知道此時的大木鶴不懷好意了。
「啦哈哈哈～」（你再靠前一步，我可就電你了哦！）
「阿鶴，你怎麼啦？」
「是啊！你變得好奇怪啊？」
「阿鶴，不要被力量迷住了雙眼。」
小智等三人在紛紛勸說著大木鶴，而一旁的阿弘也悄悄地握住了腰間的精靈球。
一旦大木鶴有所異動，那他會第一時間出面阻止的。
「咘嗚嗚哦～」（弟弟，你怎麼沒下來啊！）
「嘩啦～」
原本潛入海底的小銀，也就是異色洛奇亞的哥哥，看到弟弟沒下潛後，就立即返回來查看情況了。
「又一隻洛奇亞！」
小銀的出現，加上眾人的驚訝聲，讓這位名為修一的小男孩，內心更加慌亂。
「小銀你不要過來，這裡危險啊！」
就在雙方對峙時，一旁的兩塊礁石旁，出現了兩個身穿潛水服的火箭隊成員。
「發現目標！這裡是搜索隊C組，藍波博士請回答，藍波博士。」
「我不叫藍波，是南波。」南波博士，和小三郎有一種「同病相憐」的感覺。
兩人的名字，一直都被人叫錯。
「對不起啊！南波博士，我們發現了夢幻神奇寶貝X了。」
「馬上傳送影像過來。喔！原來夢幻神奇寶貝X是洛奇亞啊！等等，居然有兩隻洛奇亞，另一隻還是萬中無一的閃光精靈。」
「南波博士，下一步的行動是？」
「馬上展開行動，先用捕捉A方案開始嘗試。」
「是！」
「需要我出動嘛！南波博士。」一旁的山中哲也，有些毛遂自薦道。
「不！現在就讓你出動，可是大材小用啦！由亞馬多和小三郎出動就行了。」
「那好吧！」
山上哲也有些失望，其實他剛才的主動請求，只是想要出這個海下基地喘口氣而已。