「有人在嗎？打擾了！」小智一行人走了進來。
只見，裡面麻雀雖小五臟俱全，有電腦，書架，桌子椅子，在桌子上擺放著露麗力與蛇紋熊的玩偶！讓人感覺十分溫馨。
「這裡到底怎麼回事啊！」(⊙o⊙)眾人一驚。
「連個人電腦都有唉！」小遙感嘆道。
小勝則走到書架，拿出一本書說：「唉～這是神奇寶貝必勝法唉！」
「真的嗎？還有這種書？」小遙來到小勝身後，(⊙o⊙)吃驚道。
「不准碰！」眾人一驚，轉身看過去一隻土居忍士身後一個小男孩在大喊。
只不過，小男孩有點慫，心裡很緊張害怕飛快的說道：「不准你們擅自跑進我的秘密基地！」
「啊，是土居忍士！」
「秘密基地.」
「不好意思，我們不知道.」
小男孩以最慫的表情，大喊：「滾出去！滾出去！」
「那個，我們不是故意闖進來的！」
「我不聽，我不聽，土居忍士，使用瘋狂亂爪！」男孩都快哭了，直接將小智眾人趕了出去，「別讓我再看到你們！」砰！
小智眾人只好原路返回。
而隱藏起來的火箭隊，聽到他們的對話後，二話不說將小男孩趕了出去，將土居忍士留下，成為了他們的秘密基地！然後，又與板木通上了電話。
另一邊小智眾人又上了一個洞窟探索，剛看完大嘴蝠的眾人離開了洞窟！
「太棒了！我還是第一次見到這麼多的大嘴蝠！」小勝開心的表示。
「那當然了，現在是白天大嘴蝠會定住不動的！」小田卷博士解釋。
這時，小遙突然愣了一下看到一旁的岩石上坐著一個男孩，指著男孩說道：「咦～那個少年是剛才的.」
小智等人也看了過去，發現正是秘密基地中的男孩！
「不好意思，剛才擅自闖進你的秘密基地！你好，我是真新鎮的小智，你呢？」小智主動上前打招呼。「皮卡～」
「我.我叫和輝。」和輝的眼睛紅紅的好像馬上就要哭了。
「你的土居忍士怎麼了？」小勝過去將最後一根稻草壓斷！
和輝直接哭了起來，邊哭邊說：「它.它被.被壞人抓走了！」
「是不是一男一女一喵喵的人？」小智問道。
和輝點了點頭。
「啊！又是火箭隊，真是太可惡了！」(??ˇ_ˇ??:)小遙生氣的道。
「我從以前到現在，用神奇寶貝比賽從來沒有贏過。」突然和輝低落了陷入自己的回憶。
「從來沒有贏過！」小勝驚訝看著和輝。
和輝瞪起雙眼怒視著小勝。
「這個.對不起。」(??ω?? ?)小勝被嚇了一跳趕緊道歉。
「我喜歡神奇寶貝，可以我討厭用它比賽。」和輝繼續道。
「因為你沒有贏過嗎？」小剛關心的問道。
「嗯！因為老是打輸，很無聊！說真的，我已經輸到不想再輸了，只想鑽個洞躲起來，所以我才會選擇這裡，建造秘密基地的。」和輝表示實在打不過，只好在秘密基地里逃避現實了！
「那個秘密基地是你建的嗎？」小勝好奇的問道。
和輝解釋道：「不是，是土居忍士幫我建的，那裡不會有人來打擾，是屬於我跟它的小天地。」
一旁的小遙實在聽不下去了，(??へ?? ╬)大喊：「可惡！神奇寶貝比賽是沒有對手就比不起來的，你應該去收服神奇寶貝，跟朋友對戰啊，窩在自己的小空間裡，哭哭啼啼的，是改變不了現狀的！」
小智與小剛點了點表示，小遙在理論上還是很棒的，但實際上.
(￢_￢)小勝無語的說：「姐姐，你向別人勸說神奇寶貝戰鬥的事，很沒有說服力耶！」
「可是.」小遙聽到小勝拆自己的台，直接摔倒。
「這樣吧，和輝，我們一起去把土居忍士奪回來吧！」小智提議道。
和輝聽狀ヾ(＠゜▽゜@)ノ 「真的嗎？小智，謝謝你。」
另一邊的秘密基地，火箭隊已經被火岩隊趕了出去，然後開進來一個鑽頭車在牆上開出了一個隧道。
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隨後，小智他們來到了和輝的秘密基地，只是現在秘密基地里一片狼藉，桌椅等等都被損壞了，牆上還開了一個大洞，向著裡面延伸而去。
「啊！我的秘密基地被破壞了！」(?﹏?)和輝傷心道。
「太過分了！」
「是誰幹這種事的？！」
「對了，土居忍士，你在哪裡啊？」和輝開始擔心起自己的土居忍士。
「我們進去看看吧！說不定有收穫！」小智指著隧道提議道。
隨後，小智等人走進隧道，走了一會兒後，來到了一處空曠的地方，裡面聳立著一座座高高的建築物！
「沒想到，在洞窟後面有這樣的大遺蹟。」小田卷博士感嘆道。
轟！！
眾人向爆炸聲發出的方向看去，看到下方的一座建築物旁站著一個穿著紅色制服，帶著大狼犬的男人，還有穿著藍色潛水服的五個人，水中有一隻利牙魚。
「是火岩隊與水艦隊，他們來這做什麼？」小智認出那制服是曾經被自己送進監獄的火岩隊與水艦隊的成員一樣。小智也想起了這段劇情，這遺蹟並沒有什麼用，在動畫也僅僅為了引出火岩隊與水艦隊的目的而已。
「辛苦你們了，謝謝幫忙，火岩隊。」水艦隊領隊的女子嘲諷道。
「水艦隊，果然真的是你們。」火岩隊領隊的男子說道。
「這裡就留給我來處理，各位就請先走吧，要儘量避免無謂的戰鬥，以確實執行任務為優先。」女子下令道。
隨後，水艦隊的人也跑進建築物里搜查了起來。
「火村行動隊長，由你親自出動這件事情來看，火岩隊一定很看重這個遺蹟啊！」女子調侃道。
「作戰隊長泉美，你應該很慶幸這個地方有水，你才能使用最得意的利牙魚。」火村反駁道。
「搞不好還可以教你的大狼犬游泳呢！」泉美笑著回應。
「呵，要試試看嗎！」火村毫不示弱。
兩人雖然針鋒相對，但也沒真的打起來。
另一邊正在觀察的小智一行人，小遙看著開口道：「他們的關係好像很惡劣的樣子！」
「這兩個名字我聽說過，足利用神奇寶貝幹壞事的人，不過，他們到這個遺蹟來想幹什麼呀？」小田卷博士開口道。
「我們先靜觀其變，他們人太多了，看看他們想做什麼，然後再做打算吧！」小智提議道。主要是主力都不在身邊，上去這不是送死嗎？！
眾人點頭同意。
這時火村拿出對講機道：「這裡是火焰1號，內部被海洋隊的人侵入了？沒關係！繼續執行任務。」
「是。」
火村對著泉美問道：「如果沒有你們要的，而只有我們追尋的力量的話呢！」
泉美也笑著看著火村問道：「我也要問你同樣的問題，就算這裡存在著你或我們追尋的力量，你們有辦法掌控嗎！」
「難不成，你帶紅色的珠子來了！」火村冷笑道。
泉美則試探道：「有的話，你想怎麼樣呢？」
「那當然是.」火村上前，只要泉美答是，火村直接發起總攻。
兩人對峙了一會兒，泉美先退讓一步：「哼！非常的遺憾，我還沒有資格碰那個東西，估計你也還沒有資格拿出那個.藍色的珠子吧。」
不會飛的朱紅色寶珠與胖頭魚的靛藍色寶珠嗎？！不！應該不是，對應的不對，應該只是可以控制它們的珠子而已！看來兩大組織已經得到了控制它們的珠子，這是在找喚醒它們的地方，不過一群井底之蛙，海洋與大地哪有天空強，要選也是選烈空坐，小智不屑的想道。
「你為什麼要大地的力量！我們追求的海洋力量可以將一切都沖走，你們根本就是沒有勝算的！」
「不了解大地力量的人才會說這種話！」
火村與泉美相互對峙，相互嘲諷。
「咱們是不是聽到了不得了的情報啊！」小遙小心翼翼的問道。
眾人點了點頭，這情報確實不得了。
何止不得了，馬上就知道他們的最終目的了好吧！小智在心中吐槽。
這時，火村手中對講機傳來匯報：「這裡是火焰2號，全部樓層搜索完畢，到處沒有發現G的反應。」
火村聽狀直接下令：「知道了，全體人員立刻撤退。」「是！」
泉美嘲諷道：「怎麼樣啊！看樣子，你們是撲了個空了。」
這時，她的對講機發聲：「這裡是龍捲風A，遺蹟內部沒有發現K的訊號，屬下猜測這裡並不是『喚醒的小廟』，只是古人建造的祈福之塔罷了。」直接啪啪打臉！
泉美沒好氣的說：「知道了，你們可以脫離了。」早不說，晚不說偏偏這個時候說！「是！」
火村也嘲笑著看著泉美：「看來你們也是，看來這裡不是『喚醒的小廟』啊！」
泉美嘆了口氣：「我想應該是這樣吧！」
「古代人怎麼會建造這麼模稜兩可的東西。」火村無語道。
隨後，水艦隊和火岩隊集合，對峙了一會，便都撤退了。
這邊小智幾人則討論了起來。
「那些人到底是在找什麼東西啊？」小勝問道。
「不知道。」小智並不打算如實回答，一是沒根據，二是說了也沒用。小智看到火箭隊跳了出，正在歡跳，「嗯？火箭隊！」
「好耶好耶好耶.」
「那些礙事的人終於不在了！」武藏抓著被白絲纏著的土居忍士說道。
「結果那些傢伙什麼東西也沒拿就走了。」
「我們也趕快展開尋找寶物的活動吧喵。」
「索南斯～」
「土居忍士，你也要協助我們尋找哦。」武藏露出和藹的笑容道。
「土居忍士！」和輝大喊。小智眾人邊露頭怒視著火箭隊。
「把土居忍士還給我們！」
「貓頭夜鷹，用念力將我們送下去！」
貓頭夜鷹將眾人從上面，送到下面。
「喂！不准跑下來啊！」「我們還沒有開始尋寶誒！」
「皮卡丘，電光一閃加鋼尾將土居忍士解救出來！」「皮卡～」
白光閃過，將火箭隊身邊的土居忍士的白絲斬斷。
「啊！可惡的小鬼頭！」火箭隊三人組開始大喊大叫。
「好！和輝，上吧！」小智對和輝說道。
「可是我怕！」和輝有點害怕。
「和輝你要相信土居忍士！」小智鼓勵道。
和輝看見土居忍士對自己笑著點頭。
「好！土居忍士使用秘密之力！」和輝鼓起勇氣開口。
「皮卡丘，十萬伏特！」
「皮卡～丘～」
皮卡丘放出一道黃色的電流，土居忍士發出白色光線，打中了火箭隊。
「好討厭的感覺啊！」「索南斯（???）～」
隨後，小田卷博士將情報匯報給聯盟，小智與和輝打了一場，結果自然不用說，小智總不能剛出生沒多久的拉魯拉絲與水躍魚吧！所以，成為了小智的經驗，火岩鼠進階精英頂峰！
不過好在，打敗火箭隊給和輝信心，決定重建秘密基地！
未完待續