魔導戰爭，又稱第三次世界大戰，是指發生在2027-2037十年間的一系列全球規模戰事。作戰方分為神秘側和阿賴耶側，神秘側又分為親阿賴耶側和反阿賴耶側，阿賴耶側又分為政府、地方。大體流程為：開羅暴動（爆發）——東京保衛戰（相持）——倫敦巷戰（決勝），最終阿賴耶側獲得勝利。
這場戰爭波及人類七大洲四大洋，是人類史上規模最大的戰爭，波及人口40億以上，作戰面積約等於地球表面積，超大型城市四座（開羅、芝加哥、東京、倫敦）徹底損毀，中小型城市不計，經濟損失高達10萬億美元。
此次戰爭是由於第四次工業革命的不徹底性、魔術師與普通人之間矛盾加深等因素。此次戰爭客觀上促進了現代科技與魔術的融合，開啟了魔術中興的序幕（後兩句話是各國官方教材上寫的。）
背景：2022年，一位氣象學家前往冬木市研究當地氣象，意外發現當地磁場紊亂，通過不懈研究，發現了液態、固態魔力的存在，伴隨著這個發現，人造擬似魔術迴路研發完成，從此普通人也具備了使用魔力的條件，開啟了第四次工業革命，又稱魔能革命。各大神秘側組織也是在這個時候向公眾公開。
但是，普通人使用魔力嚴重破壞了魔術師團體的利益，魔術師與普通人之間的矛盾加深，為今後魔導戰爭的爆發埋下了伏筆。
過程：2027年春一月，開羅市區發生魔術師遊行示威（又稱開羅暴動）。政府並未回應魔術師的正當需求，而是採用了暴力鎮壓的方式，引起了阿特拉斯院魔術師的憤怒。魔術師主動違反了「不在普通人面前使用魔術」的禁忌，打響了魔導戰爭的第一槍。當時的埃及政府尚未更新武器裝備，又事出突然，政府在魔術師的衝擊下迅速崩潰，之後阿特拉斯院宣布接手埃及政府，並將埃及改名「阿特拉斯」。
埃及政府被接管在魔術界造成了巨大的轟動，魔術師們開始激烈地討論阿賴耶的決斷。以前魔術界從沒動過接管政府的念頭，是因為魔術師們堅信「阿賴耶抑制力不會允許神秘側過多影響常識側」，但開羅暴動的事件則為這個理論打上了一個問號，神秘側到底可不可以插手常識側？如果不能，開羅暴動不應該發生才對。
在經過漫長的討論後，時鐘塔終於確定「阿賴耶允許神秘側插手常識側」。2027年秋八月，時鐘塔宣布正式接管英國政府，2028年冬二月，彷徨海宣布獨立。
（這裡解釋一下，首先，抑制力確實不允許神秘側插手常識側，那麼為什麼開羅暴動發生了呢？
抑制力是這麼考慮的：第一，魔術師與普通人之間的矛盾天然不可調和，即使抑制力可以通過種種手段壓制神秘側，但矛盾是始終存在的。第二，魔術與普通人不可調和，但魔術可以轉化為科學。
所謂魔導戰爭，雖然明面上喊著魔術界中興，但其實上就是抑制力策劃著名加快魔術轉化成科學的進程，別說什麼魔術中興了，照這個勢頭發展下去魔術根本不會存在！啊，不過這個對魔法不適用，抑制力管不著。
換言之，魔導戰爭其實就是抑制力一手推動的，開羅暴動、時鐘塔改變方針，一切都是抑制力在暗中推動。）
2028年冬十二月，神秘側利用美國國內積怨已久的種種矛盾，煽動各個地方暴動，同時動用了埋在國會山和五角大樓的暗子，把整個美國政局攪得一塌糊塗，種族矛盾、階級矛盾、宗教矛盾、軍政矛盾等等隱患在那段時間統一爆發，徹底摧毀了美國政府的行政系統，美國分裂。
分裂後的美國大致以聖保羅——休斯頓一線為界，分為西freedom美國以洛杉磯為都，東聯合美國以華盛頓為都，墨西哥州脫離美國，而阿拉斯基州、夏威夷州、以及大量駐外美軍基地則保持了騎牆觀望的態度，南美洲則被迫站隊，戰火瞬間燃遍了整個美洲。至於澳洲？由於東西美國都想爭取到這片大陸，兩方的美軍就在上面打起來了。與此同時，彷徨海也在北冰洋對西伯利亞地區虎視眈眈，阿特拉斯院則意圖北進，經中東、地中海挺入歐洲、亞洲。
時鐘塔禍害完了美國，然後就把矛頭對準了英吉利海峽，對岸的法國神秘側力量主要是聖堂教會，當然不是時鐘塔一個人可以對抗的，因此時鐘塔聯繫了阿特拉斯院，時鐘塔在正面吸引火力，而阿特拉斯院則從馬賽偷襲上岸。
2029年冬二月，被控制的皇家海軍就這麼開到了英吉利海峽，照理說這可是世界第二海軍，不是法國海軍可對抗的，而且網絡上還流傳著「法式軍禮」這種梗······不過法國人對付德國不行，打老對手英國倒是得心應手，戰爭一直持續到夏七月，英國愣是沒占到法國海軍一點便宜。不過這個戰略還是成功了，阿特拉斯院成功從馬賽上岸，一路突到了塞爾博納，離巴黎就90來公里了。
如果繼續在英吉利海峽跟時鐘塔槓著，巴黎都要沒了，這個時刻，法國政府決定北上，起於敦刻爾克港，通過多佛爾海峽北上到荷蘭，再到丹麥，最後抵達瑞典，史稱第二次敦刻爾克大撤退。從戰略角度上來說，這次大撤退是一次戰略上的大成功，保留了法國有生力量，為反撲創造了條件，因此請謹慎玩梗。
隔壁的德國、俄國也沒閒著，彷徨海聯合德國，分別從兩個方向入侵俄國，西線戰場俄國採用堅清壁野戰術，正值春天冰雪剛融，彷徨海的補給是大問題，導致臨時拉起來的軍隊動不了了，直接困在了西伯利亞種土豆。而東線則是硬剛到底，以波蘭、白俄羅斯為緩衝地帶產生激烈衝突。阿特拉斯院在挺進耶路撒冷時遭到了聖堂教會和穆斯林的集體問候，這也產生了一個地獄笑話：在耶路撒冷如何讓兩個打的正歡的穆斯林與基督徒停下來？答：把一個阿特拉斯院魔術師拉到兩人中間。這就是歐洲戰場的局勢了。
美澳方面，東美國一開始占盡上風，突破了芝加哥防線（芝加哥市也就是在這場戰役中被打爛的。）一直壓到波特蘭市，不過西美國在澳大利亞找回了場子，基本控制了澳大利亞全境。夏威夷州就是在這個時候投了東美國，阿拉斯加州、以及大量美軍駐外基地則還在騎牆。
此時的東美國已經飄了（幾乎掌控了所有美國海軍、陸軍，換你你也飄），認為內戰勝券在握，一看隔壁東亞地區——好傢夥，全球都在打就你還沒事啊？加上東美國又是仇中的，新加入的夏威夷州又想做些什麼表忠誠，於是珍珠港就派出了一隊艦隊撲向了東南亞。
2029年秋十月，東美國依靠自身強大的實力突破了匆忙組織的太平洋防線，一路衝到了印度，並迅速「聯合」（說白就是打服）了印度政府，幫助印度政府拿下孟加拉、緬甸，然後換陸軍（主要是印度軍，裝備是美軍的）襲擊，c軍隊則在原始森林裡跟美軍玩起了游擊戰，因此被戲稱為第二越共，cloudsouth拉鋸戰也是魔導戰爭中持續時間最長的戰役。2030年春三月，巴黎徹底淪陷，德軍也推下了波蘭，與俄羅斯就隔了個白俄羅斯。
隨後是難得的一年僵持期，2031年夏八月，阿特拉斯院被壓回紅海，地中海也被義大利封鎖，從此阿特拉斯院喪失了對亞歐戰局的影響。
2032年冬一月，美印聯軍很丟人地被打跑了，還被c軍隊乘勝追擊一路打到了拉傑沙希市，打下來的緬甸、孟加拉全丟了，甚至還流傳著美軍艦隊看c軍隊打過來連夜跑回新加坡，直接拋棄了印度的傳言，不管過程如何，美國艦隊確實退回東南亞。
在馬來西亞短暫修整後，32年春三月，美軍北上襲擊，未果，轉戰日本，也就是魔導戰爭中最重要的戰役——東京保衛戰。
為了應對美軍，日本群島作為第一島鏈，屬於戰略要地，而日本本土上由於螺旋塔剛到、駐日美軍騎牆不定，自衛隊的武裝力量又有限（不要聽網上吹得有多牛，自衛隊就是自衛隊，雖然不可否認實力強勁，但不可能是大國正規軍的對手），當時日本島上是一片混亂，差點沒回到戰國時代，為了維持第一島鏈穩定、同時牽制西美軍，日本軍制恢復，從那以後就只有日本軍隊沒有日本自衛隊了。
2032年春四月，東京保衛戰爆發，葉寧武將軍（當時還不是將軍，只是少校，是在京都爭奪戰後封的將軍）率軍自長門登陸，一路西進打到東京，海軍則是搶先西美軍一步抵達東京灣，隨後就是東京保衛戰，西美軍旗艦阿賴耶號被岸防炮一炮擊沉成了戰爭史奇蹟，自珍珠港派遣的西美軍海軍主力從東京打到馬來西亞，全軍覆沒。從此戰爭進入相持階段。
2033年冬十二月，全球氣候突變，德國境內下起百年難遇的大雪，然後德國人再一次體會到了莫斯科的痛，乘德國軍隊不適應嚴寒，俄軍一路強推（代號：冬日行動），打下了柏林，國會大廈又插旗了。
與此同時，法國殘餘軍隊集結瑞典、挪威、荷蘭軍隊，兵分兩路，一路軍隊強突英國本土，一路南下巴黎，進攻英國本土的兵力當然只是佯攻，並且毫無疑問地全軍覆沒，但巴黎成功光復（法蘭西第六共和國），而西伯利亞的彷徨海軍由於缺乏資源，戰鬥力極其低下，被騰出手的c陸軍乾沒了。
2034年復活節，珍珠港美軍正在開開心心地過復活節，結果珍珠港偷襲再放映（代號：潛龍出海），不過另一個主演換成了亞洲聯合海軍，自此西美軍海軍已經喪失作戰能力。
由於在亞洲戰場持續失利，東美軍戰意低迷，被西美軍找到機會反擊，重新將戰線拉回芝加哥——休斯頓線，亞洲聯合海軍也受西美國邀請登陸美洲，東美軍節節敗退，2035年秋九月，華盛頓光復，西美國政府宣告投降。
2036年春五月，阿特拉斯院和談。
2036秋十月，爆發了魔導戰爭最後一場大型戰役——倫敦巷戰，隨後時鐘塔方面和談。2036年冬十二月，彷徨海重組。歷時十年的魔導戰爭宣告結束，常識側取得了最終的勝利。
影響：這場戰爭打擊了魔術師階級，從此魔術師不再高人一等，魔術階級掌控的大量資源的流出、以及魔術帶給生產力的大進步，很快撫平了戰爭收到的傷害。
但由於發展過於迅速，而災區修復速度遠跟不上城市發展速度，導致全球大範圍內出現了「城市墜落現象」（特指城區與戰區房發展程度區別過大，以至於走出邊界前一秒是天堂，後一面是地獄，仿佛一下從天上掉到地下），嚴重阻礙了城市發展。生產力的大進步也一定程度上緩和了貧富矛盾，但隨著新的剝削模式的出現，這個問題可能會導致在更遙遠的將來引發更大的戰爭。
魔術師這個群體的出現，使得常識側的凝聚力加強，國家的概念淡化，又加上mooncell這個可以同時容納所有人類登陸的超級靈子計算機的發現，出現了G.W.B.C.Z（global without boundaries communication zone，全球無界限交流區，其總部設立在可被人類無害訪問的mooncell表層，用以取代聯合國，主要理事國由美、中、法、俄、德、日、英組成）。
世界格局也發生了變化，原本的「一超多強」演變成了「七強」。
世界進入穩定發展期，而魔術則加快轉變成科學，不過很多看不明白的魔術師錯誤地把一些科學歸類成魔術，營造了「魔術中興」的假象。
戰果：戰後各國簽訂了《互不侵犯條約》（這名字一出，就知道是放屁了），降低了關稅，開放了移民政策，部分國家之間甚至做到了無護照越境，對魔術師的制裁減少。
值得一提的是c國本打算把所有國內魔術資源收歸國有，然後遭到了國內神秘側勢力的強烈反對，最後不了了之。
《互不侵犯條約》規定：神秘側組織不得擁有常備軍隊（聖殿騎士團因此解散，改組成聖殿騎士隊），神秘側組織不得設立諜報機構，倫敦、開羅部分地區劃為魔術自治區，彷徨海從此固定在冰島附近，其下與時鐘塔合作成立的反人類組織迦勒底解散，相關研究數據、設施、技術由G.W.B.C.Z接手（說白就是交給主要理事國家了）。