奢祟明認出了馬祥麟，他勃然大怒，喝道：「馬祥麟，爾父死於朝廷之手，不思為父報仇，反而認賊作父，襲擊我永寧軍，天不殺你我殺你！」
馬祥麟道：「我呸！爾等世受皇恩，卻犯上作亂，此為誅滅九族之罪！逆賊！本官與你勢不兩立，可敢與本官大戰三百回合！」
雙方都是領兵老手，嘴上罵著，手底下功夫不停，各自調兵遣將，整理隊列，準備進攻或反擊。
馬祥麟一番激戰，擊潰了對方的騎兵隊，擊垮了一字長蛇陣，戰果輝煌，但身邊的騎兵只有六百多人了，還讓對方追殺圍上，叛軍有絕對的人數優勢。
正在這時，馬尚風帶領的二千援軍趕至，二千援軍在上萬叛軍面前，不算什麼？但是他們有新式火槍，一千火槍手及一千白杆兵，他們完美的戰術，讓叛軍吃盡了苦頭，成功的殺出一條血路，將馬祥麟接應出重圍，往通遠門方向且戰且退。
樊龍大怒，指揮手下藤甲兵，手持藤盾牌，衝擊明軍軍陣，結果在明軍火槍手面前吃盡了苦頭，死傷無數，勉強的沖至陣前，又被越眾而出的白杆兵殺得哭爹喊娘，狼狽而逃。
樊龍道：「非石炮、盾車不足以衝破敵軍防線。」
等他們的石炮盾車調來，對方又且戰且退，脫離了他們的攻擊範圍，對方在野外，擺的是簡單的防線，當然不會呆坐在那裡讓他們使用攻城武器攻擊，迅速撤退，據險而守，這才是上策。
奢寅是一個旱鴨子，在陸地之上，他擅使一對彎刀，有萬夫不敵之勇，等閒十多個人都近不了身，掉進水裡，頓時成軟腳蟹了，猛往肚子是灌水，驚慌之極，連連大叫救命！
好得有幾個忠心不二手下，拼死跳下河去救了他出起，大伙兒筋疲力盡的在阿邊休息，剛才威風凜凜的十里一字長蛇陣，這會兒只看見遍地游兵散勇，許多人丟了武器和藤甲，正在路上遊蕩，奢寅有氣元力的道：「收攏人手，勝敗乃兵家常事，此仇不報，誓不為人。」
他的幾個手下正要亮出身份，收攏游兵，卻發現大股明軍殺至，正是且戰且退的馬祥麟和馬尚風部，他們不理逃至山裡的逃兵，對於那些在路邊的，能捉就捉，不能捉就殺，凡有抵抗的，一排火槍過去，剩下不少屍體，叛軍們大駭，能往山里逃的，儘量從山裡逃，要不然就往水裡跳。
奢寅不敢再往水裡跳了，但是又來不及往山里逃，面對明軍的火槍，只好舉手投降。
明軍將他們一綁，裹脅著迅速撤退，一路上讓他們俘虜的，就多達上千人之多。
孫飛虎看見明軍退至，忙命人打開城門，讓大軍退入。
半個時辰之內，兩千多明軍退入退城中，他們跑上城牆和城樓，脅助防守。
奢祟明親自率一萬多叛軍，黑鴉鴉殺至。
馬祥麟剛入城門，立即讓馬尚風率領一部趕往水東門，攝助防守。
城外叛軍攻城，城中早己驚動，因為巡撫、總兵、指揮使、知府、同知、兵備道等大佬被殺，城中群龍無首，亂成一團，等馬祥麟率部入城了，才有府丞率領上百衙役和壯丁趕至，更有一些大膽的百姓前來城門觀看。
孫飛虎恭迎馬祥麟入城，他行軍禮道：「卑職錦衣衛總旗孫飛虎見過千戶大人、百戶大人！」
馬尚風道：「老孫！幹得好！本官會親自向大人請功！」
馬祥麟則道：「城中現在誰人主持大局？」
孫飛虎道：「暫時不知！只有府丞周潛在大人率領上百壯丁前來支援。」
周潛雲看見馬祥麟威風凜凜，一身是血，連忙行禮：「下官重慶府丞周潛雲，拜見將軍大人，感謝將軍大人救……。」
馬祥麟道：「本官馬祥麟、石柱安撫使秦良玉之子，錦衣衛千戶，援渝城指揮官，逆賊奢祟明殺害了徐可求大人一行，公然造反，知府只怕也不在了，由你暫代知府之位，管理全城，抽調能調的衙役、壯丁協助守城，出安民告示，嚴防奸細，亂世當用重典，有趁火打劫，犯科作奸者，就地格殺，以儆效尤！」
馬祥麟說的太驚人了，周潛雲聽得心驚膽戰，兩腿發軟，他顫聲道：「下官唯大人馬首是瞻。」他同來的衙役壯丁們也紛紛下跪表態。
馬祥麟看見越來越多的百姓涌至，城外叛軍雲集，他們害怕之極，馬祥麟大聲道：「本官馬祥麟，錦衣衛千戶官，皇上早知奢祟明父子有不軌之心，密令本官在此等候，但凡馬某有一口氣在，定保渝州安全！」
在這群龍無首，人心惶惶之時，正是需要有人走出來，當仁不讓，領導大家，走出困境，你還別說，這相當有效，馬祥麟在全國都小有名氣，當他報出家門，立即有百姓大叫：「熱血豪膽、國之麒麟！」接著大伙兒都跟著叫，民心可用，士氣可用。
馬祥麟立即周潛雲打發走，讓他招募更多人手，前來助守，他們現在只剩二千五百多人，分布在兩門，顯得人手尤其的少，而叛軍則有上萬之多，占據優勢。
馬祥麟馬上命令士兵進食休息，為即將而來的大戰準備。
馬尚風則去守東水門，東水門建於明朝洪武年初，即公元1368年至公元1398年，為重慶指揮史戴鼎所建。當時戴鼎因舊址建石城，高十丈周二千六百六十有七丈，環江為池，全部石結構建築的重慶東水門，城門寬3.1米，高4.5米，厚6.6米，地勢險要之極，他們架上火槍，有一夫當夫，萬夫莫開之勢。
孫飛虎則指揮他手下的棒棒軍將十門紅衣大炮架弄上城牆。
由於巡撫徐可求根本不鳥他們，所以他們的工作極難開展，孫飛虎他們費了天大的力氣，賄賂了城門官，才將紅衣大炮弄了進去，藏於秘處，此刻派上用場了。
官方不配合，他們廠衛只好自已搞，他們從黑水艦隊調來了二十艘護衛艦，懾助防守。
但是因為河道狹窄，他們只能調來小型的蒼山船，它小型，吃水5尺，裝備千斤佛郎機2門，碗口銃3個，嚕密銃4把，噴筒40個，煙筒60個，火磚30塊，火箭100支，藥弩4張，弩箭100支。全船37人，水手4人，戰士33人，編三甲。第一甲佛郎機與鳥槍，第三甲火器，第二甲冷兵器，但是經過改裝之後，裝紅衣大炮一門，其它的全是1621式火槍。
二十艘有二十門紅衣大炮，另有火槍兵六百名，當他們收到指令後，立即封鎖各大碼頭，將所有船隻趕往萬州碼頭，集中看管，以防為叛軍奪取。
當奢祟輝奉命接管碼頭時，裡面一艘船也沒有，只有一地雞毛。
二十艘蒼山舟，來去如風，封鎖了江面，禁止叛軍進出，叛軍不知從那裡弄來了四十多艘漁船，準備過江，奪取碼頭上的船隻和貨物，二十艘蒼山舟紅衣大炮火力齊發，威力石破天驚，一舉炸毀了對方過半的船，叛軍亡魂大冒，嚇得紛紛跳河逃命，再也不敢挑戰水師了。
水師在完成轉移船隻後，率領艦隊懾助守通遠門。這裡開勢較為開闊，叛軍主力集中於此，至於東水門，由於地勢較窄又險，大部隊展不開，只好派部分人去佯攻，希望可以碰碰運氣。
叛軍大營。
奢祟明命人清點人數，他悲從心來，幾乎當場哭出聲，他精銳的騎兵折了六百人，這可是他的心肝寶貝命根子呀！
大營至通遠門不過二十里之地，他派出一萬前鋒，居然只收攏了兩千敗兵，其餘的，不是被俘就是被殺了，要麼就是逃走或者失蹤了，也就是說起事不到一個時辰，他損失了將近八千人，寸功未立，寸土未下。
尤其令奢祟明氣憤的是，他的梁王世子、行軍元帥奢寅也被俘了，奢寅是一個勇猛的戰士，就這樣窩囊的落水，窩囊的被俘了。
奢祟明大聲道：「將徐可求等人頭示眾，限時投降，否則城破之日，雞犬不留。」
立即有士兵將徐可求等人的人頭插在槍桿之上，來到城門之下，大聲道：「爾等巡撫大人己伏誅，大梁王奢祟明有令，限半個時辰之內投降，否則城破之日，雞犬不留！此就是爾等下場。」
城牆上的人大為震動，特別是剛招募三百壯丁趕至的周潛雲，他雙膝一軟跪下，放聲大哭：「中堂大人！太尊大人……何至於此！何至於此！」
馬祥麟絲毫不為所動，他厲聲道：「本官與逆賊勢不兩立，今日有你無我！押人犯來！」
孫飛虎將奢寅等十多個叛軍軍官押了上來，他們都臉色蒼白，害怕之極。
孫飛虎將俘虜們當眾殺了幾個，然後分成數十組，讓他們相互攀咬指認，這便將軍官們揪了出來，此刻全押上城來，連所謂的大梁王世子、行軍元帥奢寅也不例外。
城下的叛軍們大驚，紛紛叫道：「世子！世子！世子！」連剛才意氣風發喊話的叛軍頭目也驚得說不出話來。
馬祥麟道：「都砍了！」