1954年，米國在一次核武器實驗中，意外喚醒了一隻具有超強破壞力的巨獸哥斯拉！
面對如此龐然大物，常規武器根本沒有效果，為了將其消滅，米國動用了核彈。【Google搜索】
然而最後僅能使哥斯拉沉睡於太平洋深處。
此後各國便聯合展開所謂了「帝王計劃」，以研究徹底消滅怪獸之方法。
1973年，蘇墨青召喚出哥斯拉後，更是堅定了某些人執行「帝王計劃」的決心。
不過史前巨獸數量稀少，要找到活物研究，並不是一件容易的事情。
直到1999年，菲律賓某礦區發生地震，參與「帝王計劃」的學者芹澤市朗前往調查。
在陷坑中發現了蟲形怪獸「穆托」的石化卵囊，然後軍方秘密將其帶回研究。
轉眼數年，一群科學家圍繞著穆托的蛹進行研究。
原本蛹內的穆托，一直以來都沒有生命跡象，但不知為何，最近穆托卻產生了生命撥波動，並且頻率越來越頻繁。
主管芹澤擔心出現穆托復活，於是啟動電網，意圖殺死穆托，然而他失敗了！
原來穆托一直在吸收廢棄核電站的放射性能量，待到蓄積到足夠的能量後，便發動【電磁脈衝】癱瘓了研究所內的電子設備，破繭而出。
一頭怪獸，誰能料到對方有如此的智慧。
於是乎，米國軍方又一次成功給自己製造出了巨大的危機。
「昂~」
夜空中，恐怖的嘶鳴聲響徹天地，只見穆托扇動雙翼，行走之間，許多設備發生爆炸，掀起十數米高的火焰，許多工作人員直接被火焰焚燒致死。
火光中，穆托的身形展現在那些倖存下來的研究所工作人員眼中。
穆托與哥斯拉屬於同一時代的怪物，以放射性能量為食。
同時也將卵寄生在哥斯拉身上，讓卵吸食哥斯拉體內的能量，藉以快速孵化，然後誕生更多穆托，所以哥斯拉與穆托從遠古時期開始，一見面就不死不休。
穆托分為雄性和雌性。
相較而言，雌性穆托的體型較大，而雄性穆托體積較小，但卻擁有飛行能力。
眼前的便是一頭雄性穆托，它長著三角形的頭和顎、散發紅色的眼睛，有兩對好似翼龍羽翼的巨大前肢，胸部上也長著一堆相對較為短小的副腕，外形風格接近昆蟲，高約50米，展翼約260多米。
這隻雄性穆托剛剛從沉睡中醒來，有些起床氣，敲打著周圍的一切。
人類的體積對穆托而言太過渺小，曬牙縫都不夠，所以穆托也沒有吃人的打算。
肆無忌憚的破壞一陣後，穆托吸收了廢棄核電站殘餘的放射性能量，便雙翅一振，向著太平洋彼端而去。
當穆托飛躍過太平洋的一片海域時，深達萬米的海溝中，一雙金色的巨大獸瞳猛然睜開。
多年前被米國核彈擊沉的哥斯拉，感應到穆託身上厭惡的氣息，從沉思中醒來。
與蘇墨青的哥斯拉有所不同，這頭哥斯拉為棲息於二疊紀的巨大生物，是當時處於生態系頂點的種族的末裔。
體內擁有原子爐一樣的器官，可以自行生成巨大的熱能。
在二疊紀生物大滅絕之際，哥斯拉藏到地底下，得以逃過一劫。
原本哥斯拉一直沉睡在太平洋的海底，可是由於現代的核試驗過於頻繁，導致地表放射能濃度上升，於是再次來到地上活動。
結果剛冒頭，就被米國一顆核彈又炸暈了過去！
這頭哥斯拉，高約108米，首尾長度大概317米，重量約9萬噸。
本來哥斯拉也不想搞事情，只想安安靜靜在太平洋底當個快樂肥宅獸。
可哥斯拉與穆托之間仇深似海，不搞死對方，心裡就不舒服，所以它尾隨著雄性穆托的氣息，開始遊動。
哥斯拉在海中遊動，不容易被察覺，可是穆托大搖大擺的橫衝直撞，自然逃不過衛星雷達的掃描。
神盾局總部。
希爾特工快步走到尼克弗瑞的辦公室：「長官，一隻巨型怪獸正向米國飛來，速度很，快預計半個小時後，就會抵達夏威夷海岸。」
「巨型怪獸，還會飛，從哪冒出來的？」
尼克弗瑞負手而立，眉頭深鎖，最近糟心事比較多，雷神事件才過去沒多久，國務會那些高層吵得不可開交，現在有冒出一頭飛行巨獸。
可是職責所在，事情該辦還是得辦。
「根據軍方提供的資料顯示，這頭飛行巨獸名叫穆托，是二疊紀時期的生物，本來被安置在島國一間廢棄核電站中，由帝王組織的人員負責研究，卻不料今天穆托突然醒來……該怪獸有電磁脈衝的能力，可以破壞大部分電路儀器，上限未知」希爾將知道的重要信息一一道來。
尼克弗瑞作為神盾局局長，自然知道帝王計劃，但並不是很了解，因為他們的分工不同。
從希爾述說的情報來看，這種怪獸很早以前就存在地球上，甚至比恐龍更早，以放射性能量為食，普通武器根本對付不了！
尼克弗瑞問道：「能確認它的目標在哪嗎？」
希爾說道：「根據穆托的飛行軌跡和生物特性，它的目標應該是夏威夷的核燃料工廠，目前軍方的人已經展開了行動，很有可能會動用戰術核彈！」
夏威夷海域。
夜色之中，暗波涌動，二十六艘鋼鐵戰艦在海面形成一道防線。
主艦的作戰指揮室中，看著雷達上顯示的紅點越來越近，負責此次戰鬥的湯姆將軍表情肅穆，下達命令。
「一旦目標進入射程，立即發動攻擊。」
在湯姆將軍的命令下，戰艦上的軍人都準備起來，諸多炮口開始調整方位，齊齊對準一個方向。
百里之外的海域上，穆托巨大的身影以極快的速度掠過，帶起一片狂風呼嘯。
朦朧的月色下，穆托黝黑的甲冑，反射出金屬般的光澤，猩紅的雙眼冷漠無情，絲毫不知前方的狀況。
「攻擊。」
隨著湯姆將軍一聲令下，萬炮齊發。
「轟轟轟」
霎時間，炮火連天，無數炮彈、飛彈在夜空中星火迸射，極速飛射向穆托。
劇烈的爆炸聲中，穆托發出刺耳的哀鳴，猩紅瞳孔中透露出兇殘的殺意，它表皮不但厚，而且非常堅韌，能抵禦突擊步槍、飛彈、艦炮射擊等。
戰艦的火力雖強，可是並不能對他造成致命傷害。
「昂~」
隨著一聲怒吼，穆托的爪子中放出強力的【電磁脈衝】，那些飛射而來的飛彈、炮彈直接被衝擊波引爆。
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