雖然說很可能整個神盾基地已經淪陷，但是斯凱還是立刻組建了一支營救小分隊。
不過也僅是營救小分隊而已，雖然說在空天母艦上有更多的人手，但是神盾基地那個地方並不適合大規模的兵力調遣，而且神盾局的空天母艦也無法駛入美國公海範圍之內，更何況空天母艦也很可能是對方的攻擊目標之一。
最後的營救計劃是由斯凱擬定，托馬斯·韋弗同意的，在這種情況下，托馬斯·韋弗暫時成為了神盾局的代理局長，一旦神盾基地那邊有什麼不測，她將肩負起重建神盾局的職責。
斯凱營救小分隊只有五個人，除了她，林肯，33號特工卡拉，剩下的是兩名異人，現在整個基地當中少有的完全掌握自己能力的異人之二，一個是能夠讓附近一定範圍內的金屬融化的喬伊，一個是能夠快速移動並且彈回原點的異人艾琳娜，這樣一支精幹的小分隊希望能夠拯救危局。
他們誰也不知道究竟發生了什麼，現在的情況是所有人都無法同神盾基地聯繫起來，而且他們對神盾基地的基本布局也並不是非常的了解，多少的敵人也不清楚，整個事件就像是一團迷霧，什麼情報也沒有。
不過即便如此，他們還是義無反顧的朝神盾基地前進，畢竟現在距離出事沒有多少時間，基地即便是被九頭蛇的人攻陷一部分，但是斯凱相信，更多人的仍舊在抵抗九頭蛇的入侵。
為了避免被九頭蛇的人發現，飛機並沒有在地面降落，斯凱直接帶著小分隊從高空之中直接跳了下來，利用降落傘落在了地面上，然後通過補給井悄然進入了基地之中。
剛一進入基地，斯凱就發現了巡邏的幾名九頭蛇特工，想也不想，立刻就用能力擊倒了他們。
面對這些已經熟練掌握了自己能力的異人，神盾局的人沒有多少辦法，九頭蛇的普通特工也是同樣，他們甚至都沒有搞清楚是怎麼回事，就已經倒在了地上，被人徹底制服，就連馬利克都落入林肯的手裡。
情況比他們想像的要順利得多，沒過多久，斯凱一群人就已經重新在和風一號外面匯聚，並且成功的殺了進去，這裡面當然少不了要有一番廝殺，林肯很不幸，受了另外一名異人的攻擊，失去了意識，而那名異人則是被躲在一旁的喬伊所殺，他們很快就找到了一間正在被九頭蛇特工圍攻的房間。
而呆在房間裡的，這是科爾森，阿方索·麥肯錫，菲茲和西蒙斯，還有身受重傷的梅琳達。
基地很快就被重新奪了回來，不過吉耶拉和傳聞中已經來到這裡的九頭蛇那個怪物，卻是不見了蹤影。
儘管遭受到了不少的損失，但對神盾局來說，他們的收穫同樣很大，他們抓住了九頭蛇現存僅有的幾位元老之一馬利克，並且試圖通過他了解九頭蛇現今的狀況，還有其他九頭蛇分部的位置。
不過很可惜，現在僅存的九頭蛇分部已經沒有幾個了，在斯特拉克出事之後，九頭蛇各個分部之間已經徹底斷開聯繫，儘管九頭蛇那個怪物已經重新返回，但也根本沒法聯繫上其他幾個徹底沉寂的分部。
從馬利克的嘴裡，科爾森知道了現在他們這個分部的現狀，九頭身那怪物利用馬利克的女兒悄然將馬利克手下的分部主管全部集合起來，掌控他們，架空了馬利克，之後，他又殺死了馬利克的女兒。
科爾森也告訴了馬利克他們對於九頭蛇那怪物的了解，九頭蛇那怪物的真名叫做蜂巢。
那是一個拉丁文，指的是寄生蟲，雲集，蠶食，變更寄宿的屍體，而這些方面也同樣佐證了蜂巢的能力。
馬利克同樣告誡科爾森，要小心他手下的異人隊伍，就比如說原本馬利克手下的異人隊伍一樣，他們現在已經全部背叛了馬利克，信奉蜂巢為神，蜂巢感染他們，成為他們的一部分。
對於馬利克說的這些，科爾森理解成為精神控制，馬利克提醒科爾森，蜂巢昨晚就出現在這基地里，而他們卻沒有發現他的蹤跡，在這裡面最可能的科爾森手下的異人里，已經有人被蜂巢所感染，控制。
儘管馬利克是九頭蛇的元老之一，但在現今的情況下，科爾森覺得他沒有撒謊的道理，甚至能夠從他的說話語氣，以及他所坦誠的程度，科爾森能夠感受到馬利克希望他能夠摧毀蜂巢的渴望。
儘管半信半疑，但科爾森看向手下異人的目光里，忍不住多了一絲審視。
在看到和阿方索·麥肯錫有說有笑，並肩走過來的艾琳娜的時候，科爾森心裡有了決定，他叫過阿方索·麥肯錫，讓他悄悄的封鎖整個基地。
在這種情況下，科爾森能夠信任的人不多，梅琳達受傷很重，阿方索·麥肯錫，卡拉，菲茲和西蒙斯。
儘管這一次斯凱率領異人小分隊救了大家，但是阿方索·麥肯錫很快就冷靜下來，然後從客觀的角度上分析整件事情，如果真的有人被蜂巢所感染，潛伏在神盾局的內部，那情況就真的危險了。
情況很棘手，根據西蒙斯所說，這種感染很難被探測出來，但也沒法去直接詢問他們，這樣反而更容易引起動亂，他們不僅需要證據，還需要感染的治療方式，而唯一有用的就是他們手上那具蜂巢手下異人的屍體。
與此同時，對包括斯凱在內的四名異人，科爾森安排人展開了緊密的監視。
而這個時候，馬利克也開始對科爾森交代自己所知道的一切，為了復仇，他的最後一戰和神盾局站在一起。
梅琳達在這個時候不得不拖著病體從病床上站了起來，她用了一瓶凌霄留給她的治療藥劑，然後直接找到了阿方索·麥肯錫，現在的情況她早就看在了眼裡，雖然不知道發生了什麼，但她知道異人們已經起了疑心。
看著站在面前的梅琳達，阿方索·麥肯錫不得不告訴她現在的情況，並且向她徵求意見。
與此同時，對死亡異人屍體的解剖也有了新的進展，菲茲和西蒙斯確認死亡異人的確受到了感染，馬利克所說的那些並不是謊言，也不是刻意的挑撥離間，他說的那些都是事實。
而現在的情況是每個異人的行為都很可疑，喬伊不知所蹤，還跟林肯爭吵，艾琳娜似乎在打探基地的每個角落，而林肯則試圖給梅琳達注射麻醉藥劑，而斯凱則已經察覺到了這些異常。
就在眾人商量著是否要讓他們徹底冰凍的時候，突然，整個基地的燈光突然熄滅，馬利克的審訊室發出了異常的聲響，而趕過來的菲茲和西蒙斯剛打開門，一顆炸彈炸響了。
好在菲茲和西蒙斯離的比較遠，並沒有受到什麼傷害，不過馬利克就倒霉了，他其實在炸彈打開之後就已經死了，而爆炸的炸彈則是摧殘了他的身體，讓其他人無法從他的身上發現他的死因。
這種情況下，科爾森不得不採取強制措施，然而這些異人又有哪個是好對付的，不過好在在沒有弄清楚情況之前，他們也沒打算跟科爾森徹底翻臉，四個人主動的退出了一間辦公室之內，並且封鎖了進出的通道。
在科爾森告訴他們發生了什麼的時候，這四個人內部也產生了分歧，一旦爭吵之後，斯凱突然開口同意可以先將他們帶離基地，但是林肯卻在這個時候提出了反對意見，因為一旦他們離開，那個感染者也會離開。
斯凱的意見得到了其他兩個人的同意，她帶著他們從隱秘的通道趕往科爾森的辦公室，因為她知道在科爾森的辦公室有一個秘密電梯，能夠順利的讓大家離開基地。
其他人沒有懷疑的跟著她進入了科爾森的辦公室，然後打開了電梯門，艾琳娜，喬伊和林肯以此進入了電梯內，然而這個時候，燈光亮起，出現在他們面前的赫然是科爾森，而這裡也不是什麼電梯，而是一間隔離艙。