利用菲茲製作的假身份，梅琳達和芭芭拉進入了大開曼島一家守衛森嚴的銀行里，取走了亞歷克斯藏在保險箱裡的十幾本假護照，而根據調查，其中一本假護照的名下在葡萄牙里斯本有一座別墅。
通過調取海關的視頻，菲茲找到了亞歷克斯進入里斯本的畫面，緊跟著梅和芭芭拉立刻趕往了葡萄牙。
而在同一時間趕往葡萄牙的，還有沃德的手下，他之所以知道亞歷克斯在里斯本，是因為他接到了吉迪恩·馬利克的電話，而馬利克將亞歷克斯的所有信息全部出賣給沃德，而原因在於亞歷克斯知道的太多了。
就這樣，沃德的新分部，終於同九頭蛇殘餘的其他勢力，其他真正的勢力聯繫了起來。
這是因為極為精確的情報，所以沃德的手下早了梅和芭芭拉一步，提前趕到了別墅，控制了亞歷克斯，然後對他進行殘酷的折磨，而就在進行折磨的途中，梅和芭芭拉趕到了。
經過一番激烈的搏鬥，芭芭拉和梅擊倒了所有的九頭蛇特工，這裡面還包括沃德的副手。
然而當芭芭拉回到別墅內的時候，卻看見抱著亞歷克斯屍體的梅一臉見了鬼的模樣。
儘管經歷了殘酷的折磨，儘管在沃德的副手準備逃離的時候在他腹部狠狠的捅了一刀，但是亞歷克斯仍舊保留著最後一口氣，跟梅說出了那天爆炸的真相。
梅琳達只不過想要從亞歷克斯嘴裡問出沃德的蹤跡，然而提及沃德，意識已經模糊的亞歷克斯說出了這樣一番話：「我試圖完成沃德交給我的任務，我想要殺了他，我們都圍住他了，不知道他會變身……」
事情的開頭跟加納教授告訴給科爾森的沒有兩樣，亞歷克斯和兩名沃德的手下包圍住了加納教授，他們在地上倒滿了汽油，神盾局的特工雖然及時出現，開槍殺死一名九頭蛇的特工，但卻被另外一名特工給殺死。
然而就在這個時候，加納教授從後面走了出來，一邊走，一邊變成了可怖的怪物，就是他打暈了亞歷克斯和剩下的那名九頭蛇特工，然後點燃了汽油，製造了爆炸。
梅琳達作為現在神盾局的高層領導之一，對於斯凱所說的鞭笞是人類變形之後形成的，而且還能重新變回人類，這一切都符合亞歷克斯對加納教授的描述。
更令梅感到可怕的是，作為神盾局的心理醫生，加納教授同樣是神盾局所有被救的變異人的心理醫生，而且他同樣能夠獲得其他變異人存在的位置信息，將這一切聯繫起來，一個明顯的事實就逐漸浮現了出來。
安德魯·加納博士，她梅琳達的前夫，幾次試圖複合的前夫，她這一次為了他報仇而來的前夫，竟然是屠殺那麼多變異人的兇手鞭笞，梅琳達下意識的看向亞歷克斯，略帶祈求的說道：「這一切不是真的？」
然而彌留之際的亞歷克斯根本沒辦法回答梅琳達的問題，他就像一隻奄奄一息的小獸，滿是迷茫的問道：「他究竟是個什麼東西？」
「我不知道！」梅琳達也不知道該說什麼好，她同樣滿是迷茫，而此時的亞歷克斯終於咽下了最後一口氣。
同樣感到迷茫的，不僅是梅琳達，還有斯凱，阿方索·麥肯錫和亨特，他們三個看著出現在ATCU秘密基地里和羅莎琳肩並肩的科爾森，臉上同樣寫滿了疑惑不解，這一切究竟是怎麼一回事。
查找變異人的任務，科爾森親自擔負起來，他和ATCU的人聯手合作，而斯凱的任務就只有一個，那就是尋找鞭笞，而為了執行這一任務，他們將暫時閒置下來的亨特也拉了進來。
他們從頭開始梳理這件事情，那天弗萊被抓的事情，只有極少數的人才知道，神盾局這邊只有科爾森，阿方索·麥肯錫和斯凱三個人知情，他們三個是絕對不會對外泄露情報的，那麼問題只有可能出現在ATCU里。
正是因為鞭笞是ATCU的一員，他才會知道那麼多變異人的位置信息，所以斯凱將懷疑的人選鎖定在班克斯身上，那天他是唯一在護衛隊出發前就先走了的。
班克斯是羅莎琳的副手，他知道他們那天的行車路線，他可以查到ATCU掌握的一切關於異人族的信息。
這個懷疑目標是非常合理的，可能性很大，所以斯凱，阿方索·麥肯錫和亨特立刻對他展開了監視。
然而這邊斯凱和阿方索·麥肯錫還在商量著在班克斯的車上安裝攝像頭的事情，那邊亨特就已經貿然出手用冷凍槍擊暈了他，這種情況下，斯凱只能先取走班克斯的血液樣本，送回到神盾局總部，進行DNA檢查。
使用DNA檢查是最直接也是最方便的辦法，異人族的某些DNA片段，跟人類並不相同，一查就能查出來。
儘管從班克斯的身上沒有發現任何有價值的東西，然而他手機上傳來的一條簡訊卻引起了斯凱的注意。
「目標正被送往恩德塔克斯。」這是班克斯被冰凍之後，從一個未知號碼傳過來一條信息。
斯凱立刻在電腦上查出了恩德塔克斯的消息，那是位於蓋瑟斯堡的一座實驗室，高壓鍍鋅鐵絲網，還有虹膜識別，密密麻麻的外圍巡邏，守衛森嚴斯凱三人趕到了恩德塔克斯之後，才發覺事情比他們想像的要棘手得多。
正面闖入是不可能的，那麼現在唯一的辦法就是利用菲茲新發明的無線探測器進入實驗室進行偵查。
與此同時，斯凱接到了西蒙斯打來的電話，最後確認班克斯並沒有異人族的DNA，他並不是怪物鞭笞。
就在這個時候，恩德塔克斯實驗室的外圍突然駛來了一輛白色的大卡車，然後駛入了實驗室的內部。
通過探測器傳回來的監控畫面，斯凱他們發現ATCU的人從大卡車上卸下了一隻木箱，木箱被打開，出現在裡面的赫然是一直高強度玻璃箱，而在玻璃箱的裡面是一名陷入昏迷的變異人。
這就是ATCU的真面目，他們在恩德塔克斯實驗室存儲他們找到的變異人，就像籠中獸一樣，而就在這個時候，斯凱看到了出現在實驗室裡面，和羅莎琳肩並肩站著的科爾森。
很明顯，科爾森對羅莎琳所做的這一切並不感到意外，而且沒有反對，他已經接受了這一切。
因為嘉穎的緣故，斯凱自覺對異人族所欠甚多，這也是為什麼她始終堅持將神盾局找到的變異人通過凌霄送往一處秘密的異人族聚集地，而不是像科爾森說的那樣，組建一支由變異人組成的特戰小隊。
是的，科爾森曾經提出過要組建一支由變異人組成的特戰小隊，來應對局勢的發展。
從這一點就能看得出，科爾森的野心很大，但是由於斯凱的堅決反對，加上變異人不大願意為神盾局工作，以及後來發生的鞭笞事件，所以這件事情最後只能不了了之。
斯凱至始至終都覺得自己是異人族的成員，雖然她現在在為神盾局工作，但是看到自己的族人像是野獸一樣被關在籠子裡，這一點她的心裡非常的難受，如果這件事情科爾森不能給她一個合理的解釋，那麼……
作為異人族的一員來說，這種事情確實很難接受，但是作為人類，科爾森接受起這件事情來所以並沒有那麼多困難，羅莎琳對他給出了一個很合理的解釋。
這些變異人不過是被放在一種凍結膠質里，可以讓它們處於靜止態，健康鮮活，僅僅是沉睡著而已。
實際上ATCU這麼做也是不得已，這些變異人在轉化後都很難掌握自己的能力，甚至難以自控，有的人想自殘，有的人傷了自己愛的人，他們非常的危險，對自己如此，對其他人同樣如此。而ATCU正在研究一種針對變異人的解藥，而且就快要找到了，一旦解藥要完成，變異人將不再成為威脅。