印第安納步行者隊排名第二，戰績是56勝26負。
邁阿密熱火隊排名第三，戰績是52勝30負
紐約尼克斯隊排名第四，戰績是50勝32負。
夏洛特黃蜂隊排名第五，戰績是49勝33負。
多倫多猛龍隊排名第六，戰績是45勝37負。
底特律活塞隊與密爾沃基雄鹿戰績同為42勝40負，但因為勝負關係，底特律活塞隊排名第七，密爾沃基雄鹿隊排名第八。
西部，湖人隊展現出不小的領先優勢，他們也是今年總冠軍最大的奪冠熱門。
而衛冕冠軍馬刺隊，則因為核心球員鄧肯的重傷報銷，直接宣告退出奪冠隊列。
4月11日，馬刺隊的第78場常規賽，他們與國王隊在常規時間之內打成84:84。
鄧肯已經出戰45分鐘，但加時賽，他繼續出場，終於在一次扣籃之後重傷倒地。
賽後的核磁檢查結果出來，鄧肯膝蓋重傷，直接賽季報銷。
這讓聖安東尼奧馬刺隊球迷渴望兩連冠的美夢瞬間破碎，也讓馬刺隊管理層、包括全體球員辛苦為之拼搏了一個賽季的目標終結。
鄧肯的經紀人團隊終於為自己的任性付出了代價。鄧肯的職業生涯差點毀於一旦。但所幸，鄧肯後來的康複比較成功。但膝蓋重傷直接改變了鄧肯的球風，從一代「飛天魔鬼」逐漸向「地板流大爺」靠攏。
最終，西部的排名為：
洛杉磯湖人隊排名第一，戰績為67勝15負。
波特蘭開拓者排名第二，戰績為59勝32負。
猶他爵士隊排名第三，戰績為55勝27負。
聖安東尼奧馬刺隊與菲尼克斯太陽隊戰績同為為53勝29負，因為勝負關係，馬刺隊排名第四，太陽隊排名第五。
明尼蘇達森林狼隊排名第六，戰績為50勝32負。
西雅圖超音速隊排名第七，戰績為45勝37負。
薩克拉門托國王隊排名第八，戰績為44勝38負。
經過兩天的修整，4月22日，1999-2000賽季的季後賽正式開展。
首日，東西部各安排了兩場比賽。
東部第一場比賽，尼克斯隊的斯普雷維爾+阿蘭休斯頓+老尤因+拉里詹森四人聯手，幫助球隊以92:82擊敗黃蜂隊，
東部的第二場比賽，老米勒帶著杰倫羅斯等人，幫助步行者隊95:86擊敗希爾率領的活塞隊。
西部第一場，爵士隊的兩名老將，斯托克頓與霍納塞克分別送出10次和11次助攻，其中一半以上是助攻對內的首席得分手馬龍。老馬龍寶刀未老，出戰43分鐘，43投18中，三分球1投1中，罰球14投13中，砍下50分12籃板3搶斷。率領爵士隊104:93擊敗「手套」佩頓領先的超音速隊。
西部第二場，衛冕冠軍馬刺隊爆出冷門70:72不敵太陽隊。驟然失去對內絕對的攻防核心鄧肯，馬刺隊依舊保有不錯的防守實力，但在進攻端，他們始終找不到可以成為箭頭的人物。「海軍上將」12投3中，僅得到11分11籃板，再難抗起馬刺隊的大旗。