秋風在新幹線的車窗上輕輕划過，帶著一絲涼意，也帶著一絲不為人知的危機。
小五郎、小蘭、柯南以及少年偵探團的成員們，正一同前往京都參加一位老友的婚禮。車廂內，乘客們或低頭玩手機，或輕聲交談，一片祥和，然而這份平靜之下卻暗流涌動。
柯南坐在窗邊，無聊地望著窗外飛逝的風景。
突然，他的目光被兩個黑衣男子吸引。他們神色緊張，不時交頭接耳，似乎在密謀著什麼。
柯南的眉頭皺了起來，心中湧起一股不祥的預感。
他迅速從口袋裡掏出阿笠博士送給他的那副特製眼鏡，戴上後，眼鏡的隱藏功能立刻啟動，讓他能夠清晰地聽到那兩個黑衣男子的對話。
「炸彈已經安置好了，只要到了京都，就引爆它……」柯南大吃一驚，炸彈？新幹線上竟然有炸彈！他環顧四周，試圖尋找那兩名黑衣男子的蹤跡，但他們已經不見了。柯南知道，現在只能靠自己了。
他站起身，開始逐個車廂進行搜尋。他的目光銳利如鷹，仔細觀察著每一個乘客，試圖從他們的表情和動作中找出破綻。然而，車廂內的乘客都顯得很正常，沒有絲毫的異樣。這讓柯南更加緊張，他知道，炸彈可能就在這些看似無辜的乘客之中。
「柯南，你在找什麼？」小蘭好奇地問，她的聲音中帶著一絲擔憂。
「我在找……一個黑皮箱。」柯南沉聲道，他的眼神更加堅定。
「黑皮箱？那是什麼？」小蘭更加好奇了，她緊張地抓住柯南的手。
「那是炸彈的藏身之處。」柯南低聲道，他的聲音雖然平靜，但內心的焦慮卻如同翻湧的海浪。
小蘭聞言臉色一變，她緊張地問道：「柯南，你說的是真的嗎？新幹線上有炸彈？」
「是的，小蘭，我必須找到它，否則後果不堪設想。」柯南堅定地說，他的目光再次掃過車廂內的每一個乘客，試圖從中找到炸彈的蹤跡。
時間一分一秒地過去，柯南的搜尋卻一無所獲。他的心開始下沉，難道自己真的無法找到那個炸彈嗎？就在這時，元太的一句話突然提醒了他：「柯南，你看那個人，他手上的手錶好像有些奇怪。」
柯南順著元太的指示看去，果然發現一個人的手錶與眾不同。
那是一個計時器，而且上面的數字正在不斷跳動，顯然是在倒計時！柯南的心猛地一緊，他知道，那個人就是放置炸彈的兇手！
他迅速行動起來，一邊通知乘警，一邊設法穩住兇手。他故意裝作不經意的樣子，和兇手聊著天，試圖分散他的注意力。
同時，他的大腦在飛速運轉，思考著如何拆除炸彈並制服兇手。
「你手上的手錶是怎麼回事？」柯南厲聲問道，他的聲音中帶著一絲不容置疑的威嚴。
兇手一愣，顯然沒有料到柯南會發現他的秘密。他試圖掩飾：「這……這只是我的普通手錶而已。」
「是嗎？那為什麼上面的數字在倒計時？」柯南步步緊逼，他的目光如同利劍一般刺向兇手。
兇手的臉色變得蒼白，他知道自己的計劃已經被柯南識破了。他猛地站起身，試圖逃離車廂。然而，柯南已經提前通知了乘警，他們迅速趕來，將兇手制服。
在緊張的氣氛中，柯南迅速拆除了炸彈。他的手指靈活而準確，每一個動作都透露出他的自信和冷靜。乘客們紛紛為柯南鼓掌，他們不知道，這個看似普通的小學生，其實是一個身懷絕技的偵探。
「柯南，你真是個了不起的偵探！」小蘭激動地抱住柯南，她的聲音中帶著一絲顫抖。
「這只是我的工作而已。」柯南淡淡地笑了笑，他的眼神中透露出一種堅定和執著。他知道，這只是他無數冒險中的一次而已，而前方，還有更多的挑戰等待著他去解決。
在京都的警局裡，柯南、小蘭、小五郎以及少年偵探團的成員們被請到了一間會議室。警方已經對那名被制服的兇手進行了初步的審訊，但兇手卻一口咬定自己只是被誤認為是炸彈犯，對於炸彈的事情一無所知。
「柯南，你有什麼想法嗎？」小五郎看著柯南，希望他能給出一些線索。
柯南沉思了一會兒，然後說道：「我覺得兇手一定在隱藏什麼，他的手錶就是最好的證據。那是一個計時器，而且上面的數字在倒計時，這絕對不是普通手錶會有的功能。」
「那你覺得我們應該怎麼審訊他？」小蘭問道，她的眼神中透露出一種關切和期待。
「我們需要讓他感到恐慌，讓他覺得自己已經無處可逃。」柯南的眼神變得銳利起來，他的大腦在飛速運轉，思考著如何打破兇手的心理防線。
警方按照柯南的建議，對兇手進行了更為嚴厲的審訊。
他們告訴兇手，他們已經掌握了確鑿的證據，證明他就是炸彈犯。
同時，他們還播放了一些模擬的爆炸聲音，讓兇手感到自己仿佛已經身處爆炸之中。
在這種恐慌的氛圍下，兇手的心理防線終於崩潰了。他顫抖著聲音說道：「我……我承認，炸彈是我放置的。
但是，我也是被逼的！有人威脅我，如果我不這麼做，他們就會殺了我的家人！」
「是誰威脅你？」柯南追問道，他的眼神如同獵豹一般敏銳。
「我不知道……他們只是通過電話聯繫我，我從未見過他們的真面目。」兇手哭泣著說道，他的聲音中透露出一種無助和絕望。
柯南皺起了眉頭，他知道這個案件並沒有那麼簡單。背後一定有一個更大的陰謀在等待著他去揭開。他必須找到那個威脅兇手的人，才能徹底揭開這個陰謀。
「小蘭，你覺得這個案件和之前我們遇到的案件有什麼相似之處嗎？」柯南突然問道，他的大腦在飛速運轉，思考著這個案件和之前案件的關聯。
小蘭想了想，然後說道：「我記得之前我們也遇到過類似的案件，也是有人被威脅放置炸彈。但是，那個案件我們並沒有找到真正的幕後黑手。」
「沒錯，這個案件和之前的案件一定有關聯。我們需要找到那個威脅兇手的人，才能徹底揭開這個陰謀。」柯南堅定地說道，他的眼神中透露出一種不屈不撓的精神。
警方根據兇手的描述，開始調查那個威脅他的人。他們追蹤了兇手的電話記錄，發現了一些可疑的號碼。經過進一步的調查，他們發現這些號碼都來自於一個神秘的組織。
這個組織專門從事各種非法活動，包括威脅、恐嚇、綁架等。他們有著嚴密的組織結構和嚴格的紀律，讓警方一直難以打入其內部。
然而，柯南並不打算放棄。他相信，只要他們繼續努力，一定能夠找到這個組織的破綻，將其徹底摧毀。
經過一段時間的深入調查，柯南終於發現了這個組織的一個秘密據點。他立刻通知了警方，警方迅速行動，將這個據點一舉搗毀。
在據點中，警方找到了大量的證據，證明這個組織就是威脅兇手放置炸彈的幕後黑手。同時，他們還救出了一些被這個組織綁架的人質。
案件終於告破，新幹線上的炸彈危機也得以化解。然而，對於柯南來說，這只是他無數冒險中的一次而已。
他知道，前方還有更多的挑戰等待著他去解決。他必須時刻保持警惕，用他的智慧和勇氣去揭開每一個案件的真相，為受害者伸張正義。
在返回東京的列車上，柯南和小蘭、小五郎以及少年偵探團的成員們坐在一起。
他們的臉上洋溢著勝利的喜悅，但內心卻深知，這只是他們漫長冒險旅程中的一小段。前方，還有更多的謎團和挑戰等待他們。