有了前次哈爾濱突然丟失，大量機密檔案被繳獲。抗聯按圖索驥，幾乎將哈爾濱與偽滿濱江省，日偽原有的秘密特務組織徹底一網打盡的教訓。在此次抗聯發起南滿戰役之初，儘管北面的遼北戰場還處在僵持之中，但關東軍情報部門已經提前做了應變的準備。
不僅在民間部署與潛伏大量特務，以及原來的協和會人員。同時將關於南滿潛伏特務，以及陸續派往北滿生死不知的特務檔案，或是全部提前運往朝鮮境內或是全部的銷毀。做的是乾淨利落，沒有留下一點縫隙。
此次攻占瀋陽雖說繳獲了大批日偽檔案，查明了之前許多未解之謎。在後方也找到了不少原來關東軍修建，但是卻始終未能找到的秘密基地，並幾乎俘虜了全部的偽滿高官。但最重要文件之一的日偽潛伏特務檔案，卻並未能夠繳獲到手。
吃了多次大虧的關東軍情報部門，這次動作可謂是乾淨利落。不僅關東軍情報部門所有的檔案被轉移走，連一張紙片子都沒有留下。就連處在關東軍情報部實際控制之下，負責部分對抗聯根據地情報工作的偽滿保安局，所有檔案也被關東軍一併轉移走。
此次搶占瀋陽雖說收穫頗豐，但涉及到情報部門的檔案，只繳獲了偽滿軍警憲特武裝的偽滿軍事部，以及偽滿憲兵總團檔案。但這些主要管理明面上偽武裝的部門，檔案上的內容很是有限。
除了抓捕公開的漢奸，以及破獲明面上的那些特務組織之外，基本上起不到什麼太大的作用。在秘密戰線上擺在明面上那就是給人看的，給人看的到東西又哪裡會是真的。北滿的經驗教訓告訴抗聯，日本人的潛伏特務隱藏的相當深。
即便是在關東軍最猖獗的時期，即便是在日本人控制整個東北時期。在民間依舊潛伏了大量，用來偵察東北民眾心中反滿抗日情緒的特務。這些特務偽裝成各行各業，甚至就在你眼皮子底下，你都不知道他是日本人。
沒有繳獲到最關鍵的檔案，只抓捕到那些牌位一樣的偽滿漢奸，什麼上將、中將、少將抓的再多，也不如一個日本情報機關頭子重要。這些就連自己屬下多少兵力，什麼裝備都不清楚的高級偽軍官，那裡還知道這些東西。
即便是抓捕到了偽滿奉天警察廳長，也就是所謂的偽滿帝國保安局奉天分局的直屬上司。但這位所謂警察廳長，就連偽滿保安局奉天分局，所在的具體地位門朝哪兒開都不清楚。甚至就連奉天警察廳，有這麼一個部門都不清楚。
關東軍情報部門就是依靠這個所謂的帝國保安總局，對南滿實施鎮壓。除了關東軍情報部門直屬特務機構之外，剩下的潛伏特務之中，相當一部分都是這個帝國保安總局派出的。
而這個所謂的滿洲帝國保安總局，雖說是所謂的滿洲帝國下屬機構，但這個機構這些偽滿名義上的皇帝、大臣們，卻沒有一個人知道。抓捕到了這麼多的偽滿高層人員，包括偽滿八大部的日籍人員，供出的東西雖說不少。但是關於這方面的情報，卻是一點都沒有查到。
南滿新解放地區特務破壞活動始終未能杜絕，讓幾次受到中央點名批評的社會部，壓力可謂相當的大。眼下的東北已經被中央作為戰略大後方，南滿又是東北主要工業區之一。眼下南滿不寧，中央的整體戰略意圖也受到一定的影響。
再加上在關內與重慶方面的軍統和中統，一直沒有斷過的暗戰已經蔓延到了東北。眼下這位社會部長，身上承受的壓力可想而知。這個時候楊震對主管全東北反特工作的社會部，支持力度也不可能小。
而除了特務活動比較猖獗之外，整個南滿地區小股潰散的日軍，以及偽滿軍警憲特人員上山為匪的數量也不少。僅僅在本溪湖南部山區，就有這種大大小小的政治土匪三四餘股。遼北主要戰場之一的開原東部山區，這種土匪的數量甚至達到了兩千多人。
這些日軍殘餘兵力以及潰散上山的偽滿軍警憲特人員，在進山為匪的時候攜帶了大量的武器彈藥。這些政治土匪武器裝備精良，除了部分偽滿軍的烏合之眾外，由日軍組成的外國土匪軍事普遍素質過硬。
裝備了山炮和迫擊炮，上百挺輕重機槍，甚至還有野戰重炮。而且炮彈和彈藥數量充足的土匪，眼下恐怕在全中國也只有大戰後的東北才有。在清剿這些上山為匪的前日軍的時候，負責清剿的公安部隊損失不輕。
原本按照楊震之前的部署，在戰役準備階段軍區就從北滿老根據地，抽調公安部隊四個機動支隊、十三個機動大隊，外加從十七個軍分區所屬基幹團，各抽調出一個全建制營。負責在主力部隊完成作戰的區域，清剿日偽軍流竄的小股部隊。
並組建南滿地區各個軍分區所屬部隊，以及組建南滿地區公安武裝。但這些南下只有輕武器的公安部隊，面對這些流竄為匪，甚至可以說裝備精良的日軍殘餘武裝，以及重新上山為匪的前偽滿軍的時候，卻是調動部分完成作戰的主力部隊參戰，才大致解決問題。
在開原東部山區甚至調動了主力部隊的一個團，加上一個公安軍的一個支隊，以及三個大隊、五個機動中隊的兵力，並出動了偵察機配合。採取當年日軍圍剿抗聯採用的四面合圍，多路齊頭並進，咬住一點死追不放的戰術，才最終在開原、撫順的交界處的深山老林之中解決。
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好在這些潰散的日軍，以及上山為匪的偽滿軍警憲特人員，對這種類似於山地游擊戰的戰術，並不是很熟悉。雖說裝備遠比一般土匪精良，但是畢竟不是專業土匪。除了少數原來投降日軍的土匪出身人員之外，大部分在對付清剿部隊的時候，還是採取的正規戰術。
參戰剿匪部隊僅僅四四年十二月份到四五年三月份，在楊震調集山地第一師、一個步兵師，外加軍區特種作戰司令部四個中隊的配合之下。這四個月的時間就斃、傷、俘上山為匪的日軍潰散人員，以及偽滿軍警憲特人員一萬五餘人。
繳獲各種槍枝七千多支，輕重機槍二百多挺。山炮、迫擊炮四十多門、野炮三門，甚至還繳獲一門明治三十八年式一百五十毫米榴彈炮，三門明治三八式一百二十毫米榴彈炮，五門速射炮。抓獲獲關東軍少將一個、大佐五個，偽滿中將兩名、少將三個。
這其中不僅有為數不少的關東軍小股潰散人員，以及見勢不妙重新拖槍上山為匪的前偽滿軍官。還有大量的關東軍在覆滅之前，刻意留下來上山為匪的原偽滿憲兵、保安局，以及協和會人員。
其中大量熟悉東北情況的日本籍警察，除了突然被攻占地區之外，在反覆拉鋸以及關東軍撤退的地區，基本上都被關東軍刻意留下，並配給了大量的武器裝備、彈藥，以及電台和密碼本，讓他們潛伏到山區搞破壞。
僅僅遼西的原關東軍第四軍轄區，在第四軍向葫蘆島收縮、撤離的時候，在後方就留下了上千名由原偽滿憲兵、日籍警察，並數個正規日軍搜索小隊，組成的政治土匪武裝。在撤退的時候被截斷消滅的日軍部隊，也有不少殘存小股部隊加入其中。
到了會戰後期敗局已定的關東軍，採取了大撒把的辦法。不僅被殲滅的部隊殘存人員，在撤退無門的情況之下上山為匪，甚至有意識的將部分部隊連同那些鐵桿漢奸，以及偽滿警察中的日籍警察都拆散進入山林。
關東軍給這些人的命令是，潛伏到深山老林之中，等待迎接帝國對滿洲的全面反攻。到時候作為一支潛伏力量，搞亂敵人的大後方。同時絕對不能讓支那人，消消停停的使用南滿工業基地對帝國作戰，給帝國整體戰略製造麻煩。
至於那些偽滿警察、協和會人員，關東軍帶著嫌麻煩。其中的老抗聯叛徒，中國人所謂的鐵桿漢奸，關東軍更是不信任。與其帶著不可靠，還不如給一個名義丟在南滿，讓他們一方面給抗聯製造一些麻煩，一方面也算是為帝國盡了最後一把力。
對於關東軍來說，並沒有期待他們能夠起到多大作用，反正只要能給抗聯製造麻煩就行。為了讓這些死心塌地留在南滿堅持游擊，關東軍在這方面可謂是空前的大方。為了增加這些政治土匪武裝的活動能力，關東軍不僅將位於遼東山地，幾個儲備足夠一個師團，獨立作戰一年使用的糧食和輕武器彈藥小型秘密軍火庫，都移交給了這些人。
還給這些人留下部分黃金、偽滿貨幣，以及在必要的時候可以作為硬通貨的鴉片，甚至是大量的海洛因作為活動基金。僅僅五十瓦以上規模的大功率電台就留下了五、六部，至於各種戰術電台和電池那數量就更多了。
北滿敵後根據地經過下苦心整頓，已經無癮君子以及鴉片。但是在關東軍控制的南滿，為了聚斂財源、搜刮東北財富，關東軍壟斷的鴉片貿易還相當的興隆。雖說熱河丟了，但是關東軍在遼西，開闢了新的鴉片產地。
在關東軍多種手段的控制之下南滿吸食鴉片，甚至注射海洛因的癮君子數量極大。鴉片這種東西在北滿雖說已經人人喊打，但是在南滿在關鍵時刻，作為硬通貨使用一點問題都沒有。比解放後已經成為廢紙，還未來得及整體兌換的偽滿幣，可謂是好用的多。
而抗聯的大部隊在作戰期間，根本就沒有精力和空閒時間，去對付這些後方潰散的敵軍。在完成對關東軍主力作戰之後，大部隊又陸續調進關。只留下部分留守部隊以及公安部隊，清剿這些股匪。
但面對這些裝備精良，甚至有野戰重炮的土匪，最終還是投入了部分留守的主力部隊。採取了當年關東軍在關外，對老抗聯的圍剿。在關內對華北戰場十八集團軍部隊，進行掃蕩的戰術，採取四面合圍的辦法才殲滅了大部。