自來也留下來教導彌彥和長門，這只是戰爭中的一個小插曲。
正如自來也所說，在戰局漸漸明朗的今天，就算沒有他的戰力，戰爭也仍能結束，局勢已經往木葉有利的方向偏移。
而以自來也如今的實力與地位，在戰場上也擁有極大的自主權。
就這樣，在那處相遇的山洞不遠，自來也利用忍術建造了一座房子，與兩位少年就此住了下來。
久違的家的氣息讓兩個少年心中感動，在當天晚上，長門更是在餐桌上哭了出來。
之後，他們便徹底的在此定居，彌彥纏著自來也想要學習忍術，但自來也卻遲遲不願教導他們。
在他心中，仍是猶豫著，忍者的道路是艱難的，他不願意這兩個孩子走上這條不歸路，因此便一直拖著，至於最後如何，他現在也不知道。
這種情況大約持續了十天左右，住下來的自來也倒是難得的平靜了段時間，直到某件事的突然發生。
……
天際烏雲匯聚，大雨嘩嘩的落在屋頂，發出噼里啪啦的聲音，自來也穿著一身休閒的毛衣坐在屋中，扭頭朝窗外看去，雨水在窗上的玻璃處匯聚，如道道細小的溪流般迅速流下。
看了陣雨水，他將手中的毛筆放下，本是想趁這段時間寫點東西，結果仍是無法下筆。
時間一分一秒的過去，天色已徹底的陰沉，自來也看了下時間，已是晚上八點。
「這麼晚了，彌彥和長門怎麼還沒回來。」他心中升起了些許擔憂，不久後，穿上鎧甲迅速的離開房子。
找到彌彥他們並沒用太多的時間，兩人離屋子僅有數百米的距離，不過他們的狀態卻並不好，彌彥倒在了地上，氣息微弱，而長門則是一臉驚恐的坐在地上，看著遠處的一具忍者屍體。
自來也趕到後，迅速來到長門身旁，「發生了什麼事？」
見到自來也，長門好像有了主心骨，連忙道：「有忍者，他將彌彥打傷了，並要我們交出值錢的東西和食物，後來，後來我就不知道了。」
見到長門驚恐的模樣，自來也連忙安慰，他知道長門的性格懦弱，並不懷疑。
一邊安慰，一邊朝那名倒地的忍者望去，護額是岩忍村的標誌，「是岩忍村的中忍麼，被房子的燈光吸引來的麼，可到底是誰幹的？」
目光四掃，沒有任何發現，但在無意中掃過長門眼睛時，他渾身一震。
往常的時候，長門的紅色頭髮都是將雙眼遮蔽，因此在這段時間內，自來也並沒有見過他的眼睛，也不會特意的去探究，然而在此時，他的一隻眼睛前的頭髮卻分離，好像是被一股無形的力量所分開的。
一圈圈的白色圓輪擴散，如同輪迴。
「這是，傳說中的輪迴眼？」自來也心中無比震驚，剎那閃過無數念頭，「傳說中，整個忍界是由六道仙人所開闢的，他是忍術的始祖，是萬物的創造神，亦是萬物的毀滅神，傳說中他的眼睛，就是輪迴眼，我一直以為只是傳說，沒想到竟是真的，那長門……」
大蛤蟆仙人當初對他的預言再次閃過腦海，「莫非，長門就是那個預言中帶來變革之人，是帶來忍界和平的預言之子？」
單手下意識的握住，自來也在此刻下定決心。
……
那日之後，自來也便宣布教導兩人學習忍術，他決定引導長門，讓他能夠發揮出自己的力量，如果真的是傳說中的預言之子，那便有義務將力量用於和平。
之後教導忍術的事不用多說，自來也親自寫信送回了木葉，並沒有透露輪迴眼，只是單純的說自己暫時無法回去，接著便全心全意的教導兩人。
這一教導，便是三年，出乎了所有人的預料。
而自來也這邊暫時不去說他，卻說第三次忍界大戰，事實上在自來也留下照顧彌彥兩人時，這場戰爭已經接近了尾聲。
岩忍村組織起了大規模的進攻，但都被木葉方面打退，在雙方的數次大規模衝突中，木葉占據了上風。
勝利的天平漸漸的傾斜，可以預見，獲勝只是時間的問題，再加上新的援軍被派往了雨忍村戰場，形式對岩忍村越發的不利。
這種情況下，三代土影大野木天平起了退兵的念頭，和木葉死撐並非明智的選擇，就算岩忍村有那個實力，也是無比愚蠢的行為。
但在此時，卻發生了一件讓所有人都為之意外的事，千手繩樹死了。
身為千手直系，唯一男丁的千手繩樹死了，他是大蛇丸隊伍中的成員，卻在一次偵查任務時誤入了岩忍村的陷阱，被起爆符炸死，發現時全身的內臟已經被掏空，完全無法施救。
當綱手看到自己弟弟的屍體時，她整個人都崩潰了，誰也沒想到，在戰爭快要結束的現在，竟會發生這種事。
而這件事，也真的是一起單純的意外，團藏雖然針對了千手一族，可對於年僅十二歲的繩樹，卻沒有必殺之心，因為就算繩樹成長起來，千手也不可能恢復當年的強勢。
只能說，老天和千手開了一個玩笑，在戰爭的最後，將千手唯一的希望給抹殺。
可不管心中再怎麼悲痛，戰爭仍要繼續，在接下來的戰爭中，木葉贏得了三場大勝，岩忍村的忍者退出了雨之國境內。
木葉第四十九年三月，持續近九年的第三次忍界大戰結束，整個忍界在這次戰爭中變的千瘡百孔。
最終，仍是木葉獲得了勝利，雖然只是名義上的。
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