若狹老師看著眾人，沉思著說道：「如果知道剩下的三個暗號，應該就能解開這個謎團了。」
村田點點頭，指向美術室的方向：「第三個暗號是『不要去畫畫』，所以我們才來到美術室。」
市橋環顧四周，有些迷茫：「那從哪裡開始調查才好呢？」
柯南蹲下身子，仔細地查看著地面，似乎在尋找什麼線索。柳町好奇地問道：「小朋友，你發現什麼了嗎？」
柯南用手機拍下一張照片，然後站起來說道：「嗯，有點線索。」
村田突然想到什麼，說道：「對了，說起『不要去』的話，樓頂的畫風景畫是不被允許的吧？」
市橋也恍然大悟：「我也記起來了，好像是有人的畫板被風吹翻，差點掉下去了對吧？『不要去畫畫』會不會是指在通往樓頂的門上寫有什麼？」
村田點點頭：「柳町，我們也去看看吧。」
柳町答應了一聲，跟著村田和市橋一起向通往樓頂的門走去。柯南卻沒有跟上來，他似乎在思考著什麼，眼睛緊緊盯著手機屏幕。
小林老師注意到柯南沒有跟上，回頭喊道：「柯南，你也快點跟上來吧。」
柯南答應了一聲，卻沒有立刻行動。他仔細地看著手機屏幕，上面顯示的是他剛剛拍下的一個字——「く」。
通往樓頂的門把手上，果然寫有一個「く」。村田驚訝地說道：「通往樓梯的門把手下面，被人寫了『く』。」
市橋感嘆道：「這都過了十三年了，字跡居然還沒有被磨掉啊！」
小林老師解釋道：「自從發生那件事之後，這扇門一直鎖著不讓人上樓頂。幾乎沒有人會來碰這個門把手吧。」
市橋點點頭：「原來是這樣啊！明美連這一點都想到了，真是聰明。」
接下來是第四個暗號「醫生不能說謊」。市橋似乎對這個暗號已經有了頭緒，一行人跟著他來到了醫務室。
市橋彎下腰，仔細查看床下，仿佛在尋找什麼線索。柳町和村田站在一旁，有些好奇又有些緊張地看著市橋。
柳町忍不住問道：「喂，市橋，那裡真的會有嗎？」
村田也附和道：「是啊，我們已經找了這麼久，真的能在那裡找到線索嗎？」
市橋沒有回答，他用手機的燈光照明，仔細查看床腳的每一個角落。終於，他興奮地喊道：「找到了，找到了！雖然暗看不太清，但在床腳陰影的地方寫了一個『し』。」
柳町好奇地問道：「可是為什麼『醫生不能說謊』指的是床底呢？」
市橋解釋道：「不是有經常撒謊說自己身體不舒服，躲在醫務室逃課的孩子嘛。這個暗號可能是在提醒我們，不要對醫務室的醫生說謊。」
柯南也在細心查看床底，似乎在尋找其他線索。小林老師聽了市橋的解釋，恍然大悟道：「原來如此，那句話的意思是不能對醫務室的醫生說謊。」
柳町將目前找到的線索連起來：「好的，那麼到現在為止，我們找到的連起來讀就是yo u gu shi。」
村田點點頭：「雖然最後一個『89的護身符』還沒有弄清楚。」
市橋看著大家，信心滿滿地說道：「一定是指儲藏室了吧。我們趕快去那裡看看吧！」
柳町點頭贊同：「沒錯，時間緊迫，我們得趕緊行動。」
村田也顯得迫不及待：「那我們就趕快過去找到時間膠囊吧！」