第20章 基因
這個問題遠沒有這麼簡單。基因組學發展到今天,圍繞它的討論和爭議,從結構和功能基因組學,到生命進化,一直到哲學,甚至到學術資源政治版圖的劃分,可以寫上一個很有趣的故事。
存在即合理。
這個沒錯。
但是,存在即有用嗎?譬如我們的闌尾和智齒,它們用處不大,麻煩不小,更多地是人類進化過程中留下的遺蹟,絕非什麼寶貝。
人類基因組中98.5%的非編碼序列,也要辯證地來看。
早在20世紀六七十年代,人們就開始把非編碼序列稱為「垃圾DNA」了。
然而人們很快就發現,不少非編碼序列跟基因的轉錄調控密切相關。
垃圾並不垃圾,生命也絕非僅有中心法則。
那麼非編碼序列中都有些什麼好東西呢?教科書中經典的非編碼DNA元件,如啟動子和增強子,可動遺傳因子,還有具有生物活性的小RNA。
分子生物學發展的早期,科學家為了窺破生命這一黑箱,所設計的精妙絕倫的生物化學實驗,實在令後生拍案叫絕!
常威雙眼出現了猩紅色的光芒。
這是全球大規模合作的科研項目的典範,生物大數據的先驅。
但是他覺得大部分知識對於自己來說可能就是放在腦子裡面積灰,而不是互相碰撞,激發出靈感的火花。
《科學》雜誌社的評論家Elizabeth Pennisi總結道:「本周有三十篇論文在《自然》、《科學》等期刊上發表,宣告了垃圾DNA這一理論的死刑。ENCODE計劃已經發現,人類基因組的80%是有用的。」
「核彈已經……啟動,伱這個瘋子……」
他現在能夠以噴氣式戰鬥機一樣的飛行原理在短時間內將自己加速到超音速,而且因為體積和自身「材料強度」,戰鬥機無法突破熱障的更高的馬赫,常威卻能夠做到。
核彈爆炸的速度跟不上他的速度,那……何懼之有?
「我不想打破我的底線,畢竟我跟艾力克斯那個病毒不一樣,如果你繼續不說出來的話……」
「傑森·格林……位置是范登堡空軍基地,不過是軍事機密。」
常威的手上抓著一個正在掙扎的傢伙,那是黑色守望最高指揮官,蘭德爾將軍!
「將軍,請問你知道這個基地在哪裡嗎?」
可惜當時還沒有CRISPR,否則檢測基因組區域的功能(不管編碼非編碼)是非常地合適(Canver et al., 2017)。
開什麼玩笑,一個時代的智者想要超越一個文明的積累,找到終極答案,那是多麼天荒夜談的事情?
常威也絲毫不覺得自己是天才,有媲美愛因斯坦的靈感,如果說知識的積累的話,那常威倒是不缺。
蘭德爾將軍倒是沒有嚇得尿褲子和求饒,在常威微微鬆開手指,讓他可以從窒息之中恢復過來之後,他第一句話就是這個。
連超級士兵也吃不住常威一拳就粉身碎骨,他更吃驚的是,常威從哪裡知道這個名字,博士?可是博士不是已經……
「想要踏過一隻螞蟻而不殺死它是非常困難的,將軍。」
現在人們已經開始跟進了。
蘭德爾怎麼也沒有想到,常威突然出現,秒殺他的防衛,黑色守望的士兵在他面前好像隨手可以碾死的螞蟻,然後就真的被碾死了。
當然,後面也出現了不少推翻甚至是針對性的言論,常威因為自己的學識還不夠,所以不敢妄自下判斷。
而在這高通量、大數據為王的新世紀,非編碼DNA研究的主力毫無疑問是 ENCODE計劃。
2012年,ENCODE的研究成果集中噴發。
常威有些失望,他知道核彈已經啟動,不可能挽回,但是他不在乎。
「把自己像河豚那樣膨脹起來有時候只會更吸引捕食者,而且,誰告訴你,核彈就能摧毀我了?」
全球數十個科研團隊,用最新開發的高通量實驗方法,系統地,全面地掃描人類和其他生物各種組織中所有非編碼DNA的生物活性。
他們用的方法有ChIP-seq(檢測染色質和蛋白質的相互作用),RNA-seq(把細胞里的所有RNA分子作為一個整體測序),DNase-seq(把染色質上對DNA酶敏感的區域,也就是結構較疏鬆較暴露的區域給測序),等等等等。
常威說道。
常威笑著問。
「你……你……核彈……」
蘭德爾將軍一副視死如歸的表情。
「那我就只能先讓獵手把你撕碎吃了,然後我再吃獵手。」
蘭德爾將軍瞪大眼睛,不是,你不是應該給我一個痛快嗎?
(本章完)