自從拿下魏忠賢后，朝堂的形式可以說是風起雲湧，每日裡無數的彈章湧向朝廷，皆是彈劾魏忠賢一黨。
不管是御史，還是朝堂里其他官員，甚至是各省府縣官員，也都紛紛往朝廷送上彈章。當然，很多人的目的不是真的為了彈劾閹黨，更多的人是想通過這種方式和閹黨劃清界限。
畢竟，當初魏忠賢權傾朝野的時候，不僅朝堂，地方的官員也紛紛阿附諂媚，為魏忠賢建生祠的地方官不在少數。當然，現在那些建起的生祠紛紛被搗毀，建生祠者搖身一變又成了倒閹的急先鋒。
朝廷中，魏忠賢閹黨鐵桿如「五虎」、「五彪」、「十狗」除了朱由檢要用的許顯存和發配遼東效力的田爾耕，其他人皆被拿下問罪，六個尚書全部拿下。朱由檢已經下旨，凡是被拿下者一律罷官抄家，不僅僅是京師的家，還包括其籍貫的老家。
對文官們來說，京師只是當官任職的地方，京師內的家不會有太多財富。文官貪婪是眾所周知，但很多人畢竟還要些臉面，貪的銀子不會公然用在京中，更不會在京中建豪宅，而是把銀子運回老家，而他們依仗官身接收投獻、搶占兼併的田地，也都在其老家一帶。
所以僅僅抄了其京中的家根本抄不了多少銀子，朱由檢便派出西苑禁衛里的勛貴紈絝子弟，帶著大量錦衣衛前往犯官們的老家。
不過也僅此而已了，朱由檢不想和上一世那樣，把清查閹黨無限制的擴大。
彈劾的奏疏每天都很多，便是內閣的幾個大學士也都受到了彈劾，若是追究下去，朝堂又會為之一空，到時頭疼的還是朱由檢自己。
朱由檢下旨，清查魏忠賢一黨之事到此為止，任何人不得再以黨附魏忠賢之事進行攻訐。
「魏忠賢僅僅一人，得勢不過三四年時間，豈有天下官員盡出其門者？朝廷官員皆進士出身讀聖賢書，豈有那麼多人忠奸不分？魏閹一倒，無數人跟風彈劾，為公義亦或為私利乎？國事多艱民生積弊，各司官員應各盡其職盡忠職守，而非把所有精力都用在攻訐之上！」
朱由檢親自寫了聖旨，以邸報傳發各省。他再也不想看到上一世朝堂之上的亂局。
隨著朱由檢的聖旨傳發各省，攻訐閹黨的勢頭漸漸止住。曾經阿附過閹黨的官員終於放下心來，而欲要接著這個機會幹掉閹黨一派好從中漁利的東林黨官員也只能暫時偃旗息鼓。
於是，所有人便都把目光盯在朝堂上空出的位置。
六個尚書，大部分侍郎，正三品以上的官員便空缺了十多個。各方暗潮洶湧，符合任職條件的官員各自專營，拼命想拿下這些位置。
經過朝中官員舉薦，內閣討論之後，最終把一份長長的候選人名單擺放在朱由檢面前。
看著名單，朱由檢十分恍惚，上面的名字非常熟悉，這些人他都曾重用過他們，也都曾因為失望而罷免。
上一世的朱由檢，一開始任用官員全憑喜好，感覺哪個官聲好清廉便用哪個，後來才發現，官聲好的未必會做事，更擅長的而是嘴炮。東林黨都是清流，官聲一個比一個的好，然而帶給他卻全是失望，於是朱由檢把他們統統罷免，換上了溫體仁這樣名聲不太好的人。可是，帶給他的仍然是失望。
「《道德經》有雲，治大國如烹小鮮，朕上一世就是太過急躁，其實不管貪官也好奸臣也罷，能做事的才是好官。而某種意義上，貪官比清官更為好用，到最後大不了隨便拿個把柄撤了，還能抄家抄一筆銀子。這一世，朕的朝堂其他不說，一定要穩，那些喜歡搞事的朕一個也不用！」朱由檢暗暗道。
朱由檢邊想，目光在名單上緩緩看過。
名單上，吏部尚書候選人是王永光，王永光是萬曆二十年進士，三朝元老，為人廉潔勤政，忠厚正直，敢於直諫，朱由檢對他印象深刻，上一世的時候便是吏部尚書，因為年邁而辭官。朱由檢點點頭，在王永光名字後面劃了個鉤。
戶部尚書畢自嚴，崇禎印象更深，在上一世，畢自嚴便是戶部尚書，在崇禎登基初的幾年，殫心竭慮、興利除弊、多有建樹。那幾年，陝西流賊已起，剿賊安民需要大量銀子，關外的建奴屢次入侵京畿，使得京畿附近破敗不堪，然而在畢自嚴的運籌下，開源節流，國庫仍能維持。可惜，自己因為他袒護一個沒有完成稅收任務的知縣把他下獄，而畢自嚴罷官後，朝廷虧空愈演愈烈，只能不斷地加派三餉，現在想一想，朱由檢便感到十分後悔。重重的在畢自嚴名字後面劃了勾，這一世，朕不會再犯以前的錯誤。
禮部尚書何如寵，朱由檢搖了搖頭，這人他沒有太多印象，好像任禮部尚書沒多久便被自己罷官，沒有太多建樹。想了想，朱由檢劃掉何如寵，在旁邊寫下了徐光啟三個字。
在上一世，徐光啟也當過禮部尚書，入過閣，做的最大貢獻便是編制的《崇禎曆書》。然而，靈魂遊歷後世四百年後，朱由檢才發現，自己從來沒了解過徐光啟這個臣子，在後世，徐光啟的名氣竟然比很多重臣更大！朱由檢才發現，徐光啟學貫中西，精通天文、數學、農學，甚至是軍事，在火器運用方面別有造詣。
自己要編練禁衛新軍，禮部並沒有太多實際的工作，徐光啟可以用來督造火器火炮，對了，還有一個擅長造炮的孫元華，也可以調來京師，專門負責替朕造炮造銃。再開一個科學學院，由徐光啟任院正，培養出一批精通科學的人才。對四百年後科技之先進、文明之發達，朱由檢實在是心嚮往之。
兵部尚書閻鳴泰，朱由檢直接搖了搖頭，在上面劃了個叉，在旁邊寫上了孫承宗的名字。這個不解釋。
刑部尚書喬允升，工部尚書南居益，朱由檢都直接劃勾，沒做改變。
自此，新的六部尚書新鮮出爐。